T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=91
*
 BAD AVG GOOD
*
gi|66814240|ref   :  91
Cf_Contig1068_s   :  91
cons              :  91

gi|66814240|ref   MNLKNLETCKGLIKGSYIDQAIQGTSQFNKLLETLLIHKKLPNIG
Cf_Contig1068_s   MDERGLQLAEDLVSAHYLAAGRESLQATARTLRSLIAQRRCPDVG

cons              *: :.*: .:.*:.. *:  . :. .   : *.:*: ::: *::*


gi|66814240|ref   YNDKIIELILNEISLMDSNNFIENIGVGEREGRIYSGLVEKRHYG
Cf_Contig1068_s   LSDAVIQLLLRQLAAMDTNNFAAHVGGGEREGRVASALVRQRHFD

cons               .* :*:*:*.::: **:***  ::* ******: *.**.:**:.


gi|66814240|ref   FAHGIGRSGDITEQQPKAAGSSLIQKLTHSLVLDAMKLAGLEQSS
Cf_Contig1068_s   FTHGIGRSGDLASEQPKAAGSSLLYKLTNIMVLDLIRLAGAPS--

cons              *:********::.:*********: ***: :*** ::***  .  


gi|66814240|ref   LSNCLLLPMATGMTLALTMLTL-----KSINAN------------
Cf_Contig1068_s   TAAAVVVPMATGMTLALVLRCVAKTRVKEVDAQQQTAATTTGTTA

cons               : .:::**********.:  :     *.::*:            


gi|66814240|ref   ----NKRYVLWPRIDQKSCLKSIITAGLIPIVIPNQLDGDMIRT-
Cf_Contig1068_s   SPRVTPRYVVWPRIDQKTALKCIDSAGLLPLPVELRPAPPLTRSS

cons                  . ***:*******:.**.* :***:*: :  :    : *: 


gi|66814240|ref   ----------------------DLVAIEDKIKELG-VDNILCVFS
Cf_Contig1068_s   AEASSTDEGGPAASSSSLFLHCDVEDIAATINAVGGPAHVVCVLS

cons                                    *:  *  .*: :*   :::**:*


gi|66814240|ref   TTSCFAPRVPDKIIEISEICKRYNIGHIINNAYGLQCSKILHNIS
Cf_Contig1068_s   TTSCFAPRLPDNTVAIARYCKEHAIPYVVNNAYGVQSRRIMTRID

cons              ********:**: : *:. **.: * :::*****:*. :*: .*.


gi|66814240|ref   QACKLGRVDAFIQSTDKNFMVPVGGAIISGPNSEFIDQISRNYPG
Cf_Contig1068_s   AAQRLGRVDYVVQSSDKNFLVPVGGAVVTSSSAERCNAAAALYAG

cons               * :***** .:**:****:******:::...:*  :  :  *.*


gi|66814240|ref   RANSSPILDVFITLLSMGKQGWLNLLKERKELLIYFNEQLSKFAL
Cf_Contig1068_s   RASASPIIDLFITALSLGRRGMQELWAERYRCRRRLVDQLCGFAK

cons              **.:***:*:*** **:*::*  :*  ** .    : :**. ** 


gi|66814240|ref   ENNEKLLNTIN-------------------------------ENK
Cf_Contig1068_s   ARGEVVLVDDGEGALSGEEDAPAAAGTQAKDKKQQQQQQQQPRND

cons               ..* :*   .                               .*.


gi|66814240|ref   ISFALTLSSNNFNNNEEIISNNNNNNNNTFSMIGSKLFSRSCSGS
Cf_Contig1068_s   ISVAVTMRHFGA------AASDDDTTWSAARALGAQLFRRAVTGP

cons              **.*:*:   .        :.:::.. .:   :*::** *: :*.


gi|66814240|ref   RVIDLKSNKKLLIGGLEFNNYGSHIDNYS-TSYLTVACAIGITKL
Cf_Contig1068_s   RVVVPAPRTVTKIAGCDFHNYGMHQEGTPACPLLVVACGIGMTMA

cons              **:   ...   *.* :*:*** * :. .  . *.***.**:*  


gi|66814240|ref   EIDTFIQRLSKLFNKK
Cf_Contig1068_s   EVEGLMERLGEL---W

cons              *:: :::**.:*