T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=86
*
 BAD AVG GOOD
*
gi|29165348|gb|   :  86
Contig5077_subs   :  86
cons              :  86

gi|29165348|gb|   MGSAVGFALRKLFVYISAVLMVCAAILQMSMLKLLSFISPGRMRK
Contig5077_subs   ---------------------------------------------

cons                                                           


gi|29165348|gb|   IHMKMGERSTMTQNPKFRYEDWGPAFFSLAFIKTLFFVNWCSLGL
Contig5077_subs   ---------------------------------------------

cons                                                           


gi|29165348|gb|   EAFEGHAAPDSALITLDRQKTSVHRFLKGNRPLVLSFGSCTUPPF
Contig5077_subs   ---------------------------NADKPLVIIGGSYSXPPM

cons                                         :.::***:  ** : **:


gi|29165348|gb|   LYKLDEFKQLVKDFSNVADFLIVYLAEAHATDAWAFKNNVDISVH
Contig5077_subs   RFVVPQLHALQKEFSEKMSFVCIYIAEAHATDEWYKKKNIFLEVQ

cons               : : ::: * *:**:  .*: :*:******* *  *:*: :.*:


gi|29165348|gb|   KNLEERLAAARTLLKEDPPCPVVVDEMNNITASKYGALPERLYVI
Contig5077_subs   KQIQPPIQNYRKIFANFLHQSLLFFXILKYFLEVFASWPLRYYVV

cons              *:::  :   *.:: :    .::.  : :   . :.: * * **:


gi|29165348|gb|   QSGKVIYQASDLGGQA
Contig5077_subs   HKNKLIYK-------A

cons              :..*:**:       *