T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=91
*
 BAD AVG GOOD
*
Sps2.Perkinsus_   :  91
Lt_contig6185     :  91
cons              :  91

Sps2.Perkinsus_   VWDPTSLGLSKDFVLTSFSERKGXGCKVQPDQLSSFLPQIGDGNM
Lt_contig6185     -FDPVSLGLPAEFQLTDYTRLKGCSCKLPQPKLLTLLQELSATPG

cons               :**.****. :* **.::. ** .**:   :* ::* ::.    


Sps2.Perkinsus_   LTEDSPDCSMVPVG----DGER-VLVSSTDFLSPISQDPFHQGWI
Lt_contig6185     QKDVGVDCSIVPLQRTNSKGEALFLVSTTDFFFPSVSDPFLQGQI

cons               .: . ***:**:     .**  .***:***: *  .*** ** *


Sps2.Perkinsus_   AAANTLSDLYAVGADDINNILMILTVSMKMSPLEQTVTTKKMIEG
Lt_contig6185     GAANVLSDLYSMGIPDCDTMLMLLAASTEMDEHERLITTREIMKG

cons              .***.*****::*  * :.:**:*:.* :*.  *: :**:::::*


Sps2.Perkinsus_   FNACCEEAGTKVTGGQTVFNPWPLLGGCAMATMLQSQLVT-TDRA
Lt_contig6185     FAERAHLATTTVTGGQTVMNPWPLIGGVAMAVVSEAEMVRPTGLL

cons              *   .. * *.*******:*****:** ***.: ::::*  *.  


Sps2.Perkinsus_   VPGNVIVLTKPLGTQVTGNLALWMMNEA-QWGKVVKAGLDVETCT
Lt_contig6185     RTGDILVLTKPLGCQVAVNLKQWLLRPSPLYEDAIKGHISPEEIE

cons               .*:::******* **: **  *::. :  : ..:*. :. *   


Sps2.Perkinsus_   RAVKMGDLSMMTLNKNGCRLMREFGALGATDVTGFGLVGHADNLA
Lt_contig6185     ELYNMATDSMRRLNREGARLMRKHGAHGATDVTGFGILGHANNFG

cons              .  :*.  **  **::*.****:.** *********::***:*:.


Sps2.Perkinsus_   RVQKSGAS-----IEIDTVPTIQGCKTLSMVRPNGRDYGLLEGRA
Lt_contig6185     AAQTMGDAPRSLCLVLERLPMFKTAVAAS-KRMN-DKYRLLEGYS

cons               .*. * :     : :: :* :: . : *  * *  .* **** :


Sps2.Perkinsus_   AETSGGLLVMLRDKETAEKFIAALRAC
Lt_contig6185     PETSGGLLVAFPNTTAAEAFCAE---L

cons              .******** : :. :** * *