T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=91
*
 BAD AVG GOOD
*
Sps2.Perkinsus_   :  91
contig_36_subse   :  91
cons              :  91

Sps2.Perkinsus_   VWDPTSLGLSKDFVLTSFSERKGXGCKVQPDQLSSFLPQIGDGNM
contig_36_subse   -FDPVSLGLPAEFQLTDYTRLKGCSCKLPQPKLLALLQELSTTPG

cons               :**.****. :* **.::. ** .**:   :* ::* ::.    


Sps2.Perkinsus_   LTEDSPDCSMVPVG----DGER-VLVSSTDFLSPISQDPFHQGWI
contig_36_subse   QKDVGMDCSIVPLHHTNSKGEALFLVSTTDFFFPSVSDPFLQGQI

cons               .: . ***:**:     .**  .***:***: *  .*** ** *


Sps2.Perkinsus_   AAANTLSDLYAVGADDINNILMILTVSMKMSPLEQTVTTKKMIEG
contig_36_subse   GAANVLSDLYSMGIPDCDTMLMLLAASTEMDEHERLITTREIMKG

cons              .***.*****::*  * :.:**:*:.* :*.  *: :**:::::*


Sps2.Perkinsus_   FNACCEEAGTKVTGGQTVFNPWPLLGGCAMATMLQSQLVTTD-RA
contig_36_subse   FAERARLATTTVTGGQTVMNPWPLIGGVAMAVVSEAEMVRPAGLL

cons              *   .. * *.*******:*****:** ***.: ::::* .    


Sps2.Perkinsus_   VPGNVIVLTKPLGTQVTGNLALWMMNEAQW-GKVVKAGLDVETCT
contig_36_subse   CAGDILVLTKPLGCQVAVNLKQWLLRPSPLYEEAIAGHISPEEIE

cons               .*:::******* **: **  *::. :    :.: . :. *   


Sps2.Perkinsus_   RAVKMGDLSMMTLNKNGCRLMREFGALGATDVTGFGLVGHADNLA
contig_36_subse   ELYNMATDSMRRLNREGARLMRKHGAHGATDVTGFGILGHANNFG

cons              .  :*.  **  **::*.****:.** *********::***:*:.


Sps2.Perkinsus_   RVQKSGAS-----IEIDTVPTIQGCKTLSMVRPNGRDYGLLEGRA
contig_36_subse   AAQTVGDAPRSLCLVLERLPMFKTAVAAS-KRMN-DKYRLLEGYS

cons               .*. * :     : :: :* :: . : *  * *  .* **** :


Sps2.Perkinsus_   AETSGGLLVMLRDKETAEKFIAALRAC
contig_36_subse   AETSGGLLVAFPSTTAAEAFCAELT-A

cons              ********* : .. :** * * *  .