T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=91
*
 BAD AVG GOOD
*
Sps2.Perkinsus_   :  91
scaffold_21_sub   :  91
cons              :  91

Sps2.Perkinsus_   VWDPTSLGLSKDFVLTSFSERKGXGCKVQPDQLSSFLPQIGDGNM
scaffold_21_sub   -FDPTSVGLPEGWSLTDFSDLKG-ACKIPQNELQDMLSSLALGGT

cons               :****:**.:.: **.**: ** .**:  ::*..:*..:. *. 


Sps2.Perkinsus_   LTEDSPDCSMVPVGDGERVLVSSTDFLSPISQDPFHQGWIAAANT
scaffold_21_sub   FIE-SLDCSIRETRQGHYV-ISTTDFFFPLVDSPYLQGRIGAANV

cons              : * * ***:  . :*. * :*:***: *: :.*: ** *.***.


Sps2.Perkinsus_   LSDLYAVGADDINNILMILTVSMKMSPLEQTVTTKKMIEGFNACC
scaffold_21_sub   LSDLYAEGVQHCDFVLMLLAASLDMTPQDRTICTNLMVRGFRDAC

cons              ****** *.:. : :**:*:.*:.*:* ::*: *: *:.**. .*


Sps2.Perkinsus_   EEAGTKVTGGQTVFNPWPLLGGCAMATMLQSQLVTTDRAVPGNVI
scaffold_21_sub   TEAETTITGGQTVLNPWAIIGGVATSVVTRDEYVSSDGACVGDVI

cons               ** *.:******:***.::** * :.: :.: *::* *  *:**


Sps2.Perkinsus_   VLTKPLGTQVTGNLALWMMNEAQWGKVVKAGLDVETCTRAVKMGD
scaffold_21_sub   VLTKPIGTQIAVNVHEWRKRHEKKAKNGDTTGDKNS-EIMMHAAV

cons              *****:***:: *:  *  .. : .*  .:  * ::    :: . 


Sps2.Perkinsus_   LSMMTLNKNGCRLMREFGALGATDVTGFGLVGHADNLARVQKSGA
scaffold_21_sub   RSMSKLNRFGSKLMTKHNAHAGTDVTGFGLLGHAQNLMDNQIAKV

cons               ** .**: *.:** :..* ..********:***:**   * : .


Sps2.Perkinsus_   SIEIDTVPTIQGCKTLSMVRPNGRDYGLLEGRAAETSGGLLVMLR
scaffold_21_sub   GIELHTFPCIAN--TLK-INDNIMNFRLRDGYSAETSGGLMISMT

cons              .**:.*.* * .  **. :. *  :: * :* :*******:: : 


Sps2.Perkinsus_   DKETAEKFIAALRAC
scaffold_21_sub   E------------AD

cons              :            *