T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=78
*
 BAD AVG GOOD
*
EhSep2_emiliani   :  78
PHYCAscaffold_7   :  78
cons              :  78

EhSep2_emiliani   MALRSLTLLCAAAGASAGAIELTPDNFDELVLKSGKAAFIKFLAP
PHYCAscaffold_7   ------------------VLVLTEGNFAEAVS-GHDTLLVEFYAP

cons                                .: ** .** * *  . .: :::* **


EhSep2_emiliani   WXGHCKKMKPDWDSLASTFED-SKKVLIADVDCTTGGKPLCEKYG
PHYCAscaffold_7   WCGHCKKLAPEYSVAAKNLKELDPPIRLAKVDATAESK-LAEQFG

cons              * *****: *::.  *..::: .  : :*.**.*: .* *.*::*


EhSep2_emiliani   VRGYPTIKYFNPPDEEGEDYKGGRSLDELKKFAENELGPGCSVDL
PHYCAscaffold_7   IRGFPTLKFFKGDVEAVKDYDGGRTSAEIEKWVVKKSGPAVKI--

cons              :**:**:*:*:   *  :**.***:  *::*:. :: **. .:  


EhSep2_emiliani   MDNCSEEQKGKLKEYIDMAPEKRTEMLETLKKELADAESTHEALL
PHYCAscaffold_7   VETA-EEL-KELKEANDV------------------------VVF

cons              ::.. **   :***  *:                        .::


EhSep2_emiliani   KELQATYKESMDKLEKLKEESAPKIKLLKAATPAPKAEGAKDEV
PHYCAscaffold_7   AVIDAEEGEARTLLEKLA-----------------------DAD

cons                ::*   *:   ****                        *