T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=91
*
 BAD AVG GOOD
*
EhSep2_emiliani   :  91
contig_34_subse   :  91
cons              :  91

EhSep2_emiliani   MALRSLTLLCAAAGASAGAIELTPDNFDELVLKSGKAAFIKFLAP
contig_34_subse   ------TSLAYPYGRSSAVTELTPASLHAFV-NTHKPVVILFYAP

cons                    *. . * *:.. **** .:. :* :: *...* * **


EhSep2_emiliani   WXGHCKKMKPDWDSLASTFEDSKKVLIADVDCTTGGKPLCEKYGV
contig_34_subse   WCGHCKQFHPEYERFAESVKGTIRVGAIDADKN---ADIGQQFGV

cons              * ****:::*::: :*.:.:.: :*   *.* .     :::**


EhSep2_emiliani   RGYPTIKYFNPPDEEGEDYKGGRSLDELKKFAENELGPGCSVDLM
contig_34_subse   RGFPTIKYW------------------------------------

cons              **:*****:                                    


EhSep2_emiliani   DNCSEEQKGKLKEYIDMAPEKRTEMLETLKKELADAESTHEALLK
contig_34_subse   ---------------------------------------------

cons                                                           


EhSep2_emiliani   ELQATYKESMDKLEKLKEESAPKIKLLKAATPAPKAEGAKDEV
contig_34_subse   -------------------------------------------

cons