T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=88
*
 BAD AVG GOOD
*
EhSep2_emiliani   :  88
contig_06_subse   :  88
cons              :  88

EhSep2_emiliani   MALRSLTLLCAAAGASAGAIELTPDNFDELVLKSGKAAFIKFLAP
contig_06_subse   LAVALL-AVC----AKAEVVELNPANFHNVVKDPSKNVFVMFYAP

cons              :*:  *  :*    *.* .:**.* **.::* ...* .*: * **


EhSep2_emiliani   WXGHCKKMKPDWDSLASTFEDSKKVLIADVDCTTGGKPLCEKYGV
contig_06_subse   WCGHCNNMKPTWLELADKYPIVGDVIIARIDASE-YRGIAKEFDI

cons              * ***::*** * .**..:    .*:** :*.:   : :.:::.:


EhSep2_emiliani   RGYPTIKYFNPPDEEGE-DYKGGRSLDELKKFAENELGPGCSVDL
contig_06_subse   HGFPTLKFFSKRDKSGKMEYEGPRELSAFVAYVAAN-KQRCTAAT

cons              :*:**:*:*.  *:.*: :*:* *.*. :  :.  :    *:.  


EhSep2_emiliani   MDNCSEEQKGKLKEYIDMAPEKRTEMLETLKKELADAESTHEALL
contig_06_subse   ANNCSSRE-------------------------------------

cons               :***..:                                     


EhSep2_emiliani   KELQATYKESMDKLEKLKEESAPKIKLLKAATPAPKAEGAKDEV
contig_06_subse   -------------------------------------------R

cons