T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=92
*
 BAD AVG GOOD
*
EhSep2_emiliani   :  92
scaffold_23_sub   :  92
cons              :  92

EhSep2_emiliani   MALRSLTLLCAAAGASAGAIELTPDNFDELVLKSGKAAFIKFLAP
scaffold_23_sub   ------AFLVVGTANASGAAEITQENHAS--LTKGKNSFIKFLAP

cons                    ::* ..:. ::** *:* :*. .  *..** :*******


EhSep2_emiliani   WXGHCKKMKPDWDSLASTFEDSKKVLIADVDCTTGGKPLCEKYGV
scaffold_23_sub   W-GHCKSMKPAWDQLGDEFAGSSSVVIGDADCTASGEEICQTFGI

cons              * ****.*** **.*.. * .*..*:*.*.***:.*: :*:.:*:


EhSep2_emiliani   RGYPTIKYFNPPDEEGEDYKGGRSLDELKKFAENELGPGCSVDLM
scaffold_23_sub   KGYPTIKYFLDGDSEGTDYQGGRDYDSLKAFVEDTLEVKCSVTDQ

cons              :********   *.** **:***. *.** *.*: *   ***   


EhSep2_emiliani   DNCSEEQKGKLKEYIDMAPEKRTEMLETLKKELADAESTHEALLK
scaffold_23_sub   ELCTDKEKAYIEKMKTKPSEDRVKQITRLEKMAGD----------

cons              : *::::*. :::    ..*.*.: :  *:*  .*          


EhSep2_emiliani   ELQATYKESMDKLEKLKEESAPKIKLLKAATPAPKAEGAKDEV
scaffold_23_sub   ------------------------------------------S

cons