T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
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SCORE=81
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 BAD AVG GOOD
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EhSep2_emiliani   :  81
Cf_Contig844_su   :  81
cons              :  81

EhSep2_emiliani   MALRSLTLLCAAAGASAGAIELTPDNFDELVLKSGKAAFIKFLAP
Cf_Contig844_su   ----------AAAEEASRVVELNRDNFDDYVRGPMKHTFVLYCVK

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EhSep2_emiliani   WXG-HCKKMKPDWDSLA--STFEDSKKVLIAD-VDCTTGGKPLCE
Cf_Contig844_su   W-SRPCKSARETWNRMSISQSSKELRDVFTAAYVDG-DKYPDIID

cons              * .  **. :  *: ::  .: :: :.*: *  **       : :


EhSep2_emiliani   KYGVRGYPTIKYFNPPDEEGEDYKGGRSLDELKKFAENELGPGCS
Cf_Contig844_su   KMGVQGFPTLTFYTPIYPEGVEYKGSRELFLLDS-----------

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EhSep2_emiliani   VDLMDNCSEEQKGKLKEYIDMAPEKRTEMLETLKKELADAESTHE
Cf_Contig844_su   ---------------------------------------------

cons                                                           


EhSep2_emiliani   ALLKELQATYKESMDKLEKLKEESAPKIKLLKAATPAPKAEGAKD
Cf_Contig844_su   ---------------------------------------------

cons                                                           


EhSep2_emiliani   EV
Cf_Contig844_su   -F

cons               .