T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
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SCORE=91
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 BAD AVG GOOD
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EhSep2_emiliani   :  91
Cf_Contig800_su   :  91
cons              :  91

EhSep2_emiliani   MALRSLTLLCAAA---GASAGAIELTPDNFDELVLKSGKAAFIKF
Cf_Contig800_su   -------LQCATAFPYGRSSAVTELTPATFPNFV-NTHKPVVILF

cons                     * **:*   * *:.. **** .* ::* :: *...* *


EhSep2_emiliani   LAPWXGHCKKMKPDWDSLASTFEDSKKVLIADVDCTTGGKPLCEK
Cf_Contig800_su   YAPWCGHCKQFHPEFERFAASMKGTMRVGAIDADQHS---SIGQQ

cons               *** ****:::*::: :*::::.: :*   *.*  :   .: ::


EhSep2_emiliani   YGVRGYPTIKYFNPPDE---EGEDYKGGRSLDELKKFAENELGPG
Cf_Contig800_su   YGIRGFPTIKYWKMGTKSIASPQDYQGQRTAAALQSYLVSDIT--

cons              **:**:*****::   :   . :**:* *:   *:.:  .::   


EhSep2_emiliani   CSVDLMDNCSEEQKGKLKEYIDMAPEKRTEMLETLKKELADAEST
Cf_Contig800_su   ---------------------------------------------

cons                                                           


EhSep2_emiliani   HEALLKELQATYKESMDKLEKLKEESAPKIKLLKAATPAPKAEGA
Cf_Contig800_su   ---------------------------------------------

cons                                                           


EhSep2_emiliani   KDEV
Cf_Contig800_su   ---P

cons