T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
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SCORE=75
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 BAD AVG GOOD
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EhSep2_emiliani   :  75
Cf_Contig1034_s   :  75
cons              :  75

EhSep2_emiliani   MALRSLTLLCAAAGASAGAIELTPDNFDELVLKSGKAAFIKFLAP
Cf_Contig1034_s   --------------AMPGVVQMTKANFKQLVGKK-QAALVEFYAP

cons                            * .*.:::*  **.:** *. :**:::* **


EhSep2_emiliani   WXGHCKKMKPDWDSLASTFEDSKK----VLIADVDCTTGGKPLCE
Cf_Contig1034_s   WCGHCKHMAGEYAALGAAFQNSKTAKDVLVIGKVDATQ-ERDLGK

cons              * ****:*  :: :*.::*::**.    ::*..**.*   : * :


EhSep2_emiliani   KYGVRGYPTIKYFNPPDEEGEDYKGGRSLDELKKFAENELGPGCS
Cf_Contig1034_s   EYGVSGFPHHSLLP------------RRIDEADQVRERPHRRG--

cons              :*** *:*  . :             * :** .:. *.    *  


EhSep2_emiliani   VDLMDNCSEEQKGKLKEYIDMAPEKRTEMLETLKKELADAESTHE
Cf_Contig1034_s   ---------------------------------------------

cons                                                           


EhSep2_emiliani   ALLKELQATYKESMDKLEKLKEESAPKIKLLKAATPAPKAEGAKD
Cf_Contig1034_s   ----------------------------------LPAF----LVR

cons                                                 **        


EhSep2_emiliani   EV
Cf_Contig1034_s   ED

cons              *