T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
 BAD AVG GOOD
*
PHYCAscaffold_1   :  94
eEFsec.Droso.SP   :  94
cons              :  94

PHYCAscaffold_1   --LNVNVGVLGHVDSGKTSLVRALSTQLSTAALDKHPQSQQRGIT
eEFsec.Droso.SP   MPINFNIGLLGHVDSGKTTLAKALSSISSTAAFDKNPQSVERGIT

cons                :*.*:*:*********:*.:***:  ****:**:*** :****


PHYCAscaffold_1   LDLGFSSFLLKPSAQVK--PCLQVTLVDCPGHASLFRTILGGVAI
eEFsec.Droso.SP   LDLGFSGLLVDAPAHLPQGEQLQFTFVDCPGHASLIRTIIGGAQI

cons              ******.:*:...*::     **.*:*********:***:**. *


PHYCAscaffold_1   IDTVLLVIDCRKGLQAQTIESLLLATLIAKRSVVVALTKTDLVPS
eEFsec.Droso.SP   IDLMLLVVDAQKGKQTQTAECLIIGELLQKKLI-VVINKIDVYPE

cons              ** :***:*.:** *:** *.*::. *: *: : *.:.* *: *.


PHYCAscaffold_1   AERDNVIGKCSHE-VRSFMATNFNFHDTSSIPVVPVAVGSNQDPQ
eEFsec.Droso.SP   NQRASKLEKLRLRLAKTLEATTFGG-------QVPICAVSALQGT

cons               :* . : *   . .::: **.*.         **:.. *   


PHYCAscaffold_1   GIPQLLEALNANLQVPERDHSGSFCLAVDHCFSVPGNGTILTGTV
eEFsec.Droso.SP   HIAELREVLREAYFQPQRNLADPLFMYVDHCFGIKGQGTVCTGTL

cons               *.:* *.*.     *:*: :..: : *****.: *:**: ***:


PHYCAscaffold_1   LSGALERGDELELLPLGAKVKVKTLQVFKKDVAKCSQGDRVGLRV
eEFsec.Droso.SP   LQGKVQVNNVIELPALGEQRKVKSIQMFRKNVTSASMGDRIGLCV

cons              *.* :: .: :** .** : ***::*:*:*:*:..* ***:** *


PHYCAscaffold_1   NGLDPALVERALAVSPPGSLTPVTQVVIPVTKVPFFHEISCKSGG
eEFsec.Droso.SP   TQFNAKLLERGI-ITQPGYLKPIYAVCLQFKPIRYYKEV-IKSMR

cons              . ::. *:**.: :: ** *.*:  * : .. : :::*:  **  


PHYCAscaffold_1   KCHVTVGHTTIIAMATFFTCLGGDKGDETGFNPSALYEYVEELSD
eEFsec.Droso.SP   KMHISVGHNTVMANVTLFRDT---DGTTSTFQLDKEYEYMEDVQP

cons              * *::***.*::* .*:*      .*  : *: .  ***:*::. 


PHYCAscaffold_1   EKEAEEGMIFALLQFEQAVFCPPKTLVVCSRMDLDAKRFPCRLAF
eEFsec.Droso.SP   AEVQHNDVIYALLQFESPVLSPPHSTLIASKLDMDVHSTSCRLAF

cons               :  .:.:*:******..*:.**:: ::.*::*:*.:  .*****


PHYCAscaffold_1   YGVIQGVVGSREKFTLRLFKLMALKPPKLKGKATGPGQSLKTTVK
eEFsec.Droso.SP   WGRIAWQTHSSKYFQEELPKLRIFKRKQKVGSIQRVVNSSEVIVQ

cons              :* *   . * : *  .* **  :*  :  *.     :* :. *:


PHYCAscaffold_1   AVEKDVESISIDSSALRLAEPKSGQIERLKGETTAAAKKKHTLLR
eEFsec.Droso.SP   NLFKDAKRDLYVGKNVELSTGEKGRIERTFGQTSKVAITFQDALS

cons               : **.:     .. :.*:  :.*:***  *:*: .* . :  * 


PHYCAscaffold_1   KQLAFNMHSVKVRINLKKRQILTQREL-F
eEFsec.Droso.SP   PETISNVKNVKVLLNCKKYVFNKQAGLFQ

cons               :   *::.*** :* **  : .*  *