T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
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SCORE=67
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 BAD AVG GOOD
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Cf_Contig741_su   PQSQS----RGITLDLGFSASANLDKVQCTLVDCPGHASLIRTVV
eEFsec.Celegans   ATSTTTDGIRRNTLDLGFSTMTSLSGRRLALIDCPGHSGLIRAVL

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Cf_Contig741_su   GGAQIIDAMVLVIDATKGMQAQTAECLVLGEVL-AKPLVVALNKV
eEFsec.Celegans   AASTVFDMAIVIIDVVAGIQPQTAEHLLLASKFCPNRVIIVLNKC

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Cf_Contig741_su   IAWASVLRNSTLPRWS--VGCFAARPAASAHLSAPRSSLRRCTRC
eEFsec.Celegans   ---NEKRRVKTLETWKQRVGQVAA-GARAAFLVAPSFDEHRFSRC

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cons                                                           


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cons                                            .* ***.. :     


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cons                                                        *  


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eEFsec.Celegans   GKFRVTFAEKIDGILTEKEEISLFLKKYHNENRLVSYVPD

cons