T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=99
*
 BAD AVG GOOD
*
PHYCAscaffold_1   :  99
PHYCAscaffold_1   :  99
cons              :  99

PHYCAscaffold_1   SIATFAAGCFWAVQRSFDNVPGVIATSVGYAQGKTENPTYRTVVT
PHYCAscaffold_1   NVATFAAGCFWGVQLAFDRVPGVLETSVGYTQGSVDSPTYRQVCT

cons              .:*********.** :**.****: *****:**..:.**** * *


PHYCAscaffold_1   GRTNHAESIKITFDESQVTYEELLKVFWSIHDPTSLNRQEGDVGT
PHYCAscaffold_1   GRTNHAEAINIVFDDSQVSYDALLKKFWSIHDPTTLNRQKNDKGT

cons              *******:*:*.**:***:*: *** ********:****:.* **


PHYCAscaffold_1   QYRSGIYYQDEEQHKIALKSKDEHQKTLDKPIVTEIEAAKTFWDA
PHYCAscaffold_1   QYRSGIYYHNDDQRKAALASKEEYQKTLSKPIVTEIMEAKQFWDA

cons              ********::::*:* ** **:*:****.*******  ** ****


PHYCAscaffold_1   EEAHQKYLEKGGN
PHYCAscaffold_1   EDYHQKYLEK---

cons              *: *******