T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=89
*
 BAD AVG GOOD
*
scaffold_6_subs   :  89
SPP69000050_1.0   :  89
cons              :  89

scaffold_6_subs   MPSNSPSIPNLELATIAGGCFWGLELALQRLDGIKYTLVGYTQGL
SPP69000050_1.0   MATNGNGASGAELATFALGXFWHPEASFANVPGVVKTRVGYTGGS

cons              *.:*. . .. ****:* * **  * :: .: *:  * **** * 


scaffold_6_subs   DKEVKPNYEQVSSGNTNHCEAVIIYYDPSIVSYETVLRAVLDRVD
SPP69000050_1.0   --RPNPTYESVCAGD-GHTEAMRVWFDPAIISYEDLLKQFFREHD

cons                . :*.**.*.:*: .* **: :::**:*:*** :*: .: . *


scaffold_6_subs   ITTVNGQGRDYGKQYRTGIYFHTIQQQEIARRILSEELIINPKYK
SPP69000050_1.0   PTQK------SKCQYKSAVWYHSEAHGTALAAVMKE-------LE

cons               *           **::.:::*:  :      ::.*        :


scaffold_6_subs   NNKKIKIATELKPAKAFWPAEDYHQQYLEK-----------
SPP69000050_1.0   GKYRVRLATTVDPAGDWWDAEEYHQKYIEKSMMRRGSAGWW

cons              .: ::::** :.**  :* **:***:*:**