T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
 BAD AVG GOOD
*
SPP00000092_1.0   :  94
PHYCAscaffold_1   :  94
cons              :  94

SPP00000092_1.0   MPINFNIGLLGHVDSGKTTLAKALSSISSTAAFDKNPQSVERGIT
PHYCAscaffold_1   --LNVNVGVLGHVDSGKTSLVRALSTQLSTAALDKHPQSQQRGIT

cons                :*.*:*:*********:*.:***:  ****:**:*** :****


SPP00000092_1.0   LDLGFSGLLVDAPAHLPQGEQLQFTFVDCPGHASLIRTIIGGAQI
PHYCAscaffold_1   LDLGFSSFLLKPSAQVK--PCLQVTLVDCPGHASLFRTILGGVAI

cons              ******.:*:...*::     **.*:*********:***:**. *


SPP00000092_1.0   IDLMLLVVDAQKGKQTQTAECLIIGELLQKKLI-VVINKIDVYPE
PHYCAscaffold_1   IDTVLLVIDCRKGLQAQTIESLLLATLIAKRSVVVALTKTDLVPS

cons              ** :***:*.:** *:** *.*::. *: *: : *.:.* *: *.


SPP00000092_1.0   NQRASKLEKLRLRLAKTLEATTFGGQVPICAVSALQGTHIAELRE
PHYCAscaffold_1   AERDNV-----------------IGKVPVAVGSNQDPQGIPQLLE

cons               :* .                   *:**:.. *  :   *.:* *


SPP00000092_1.0   VLREAYFQPQRNLADPLFMYVDHCFGIKGQGTVCTGTLLQGKVQV
PHYCAscaffold_1   ALNANLQVPERDHSGSFCLAVDHCFSVPGNGTILTGTVLSGALER

cons              .*.     *:*: :..: : *****.: *:**: ***:*.* :: 


SPP00000092_1.0   NNVIELPALGEQRKVKSIQMFRKNVTSASMGDRIGLCVTQFNAKL
PHYCAscaffold_1   GDELELLPLGAKVKVKTLQVFKKDVAKCSQGDRVGLRVNGLDPAL

cons              .: :** .** : ***::*:*:*:*:..* ***:** *. ::. *


SPP00000092_1.0   LERGI-ITQPGYLKPIYAVCLQFKPIRYYKEV-IKSMRKMHISVG
PHYCAscaffold_1   VERALAVSPPGSLTPVTQVVIPVTKVPFFHEISCKSGGKCHVTVG

cons              :**.: :: ** *.*:  * : .. : :::*:  **  * *::**


SPP00000092_1.0   HNTVMANVTLFRDT---DGTTSTFQLDKEYEYMEDVQPAEVQHND
PHYCAscaffold_1   HTTIIAMATFFTCLGGDKGDETGFNPSALYEYVEELSDEKEAEEG

cons              *.*::* .*:*      .*  : *: .  ***:*::.  :  .:.


SPP00000092_1.0   VIYALLQFESPVLSPPHSTLIASKLDMDVHSTSCRLAFWGRIAWQ
PHYCAscaffold_1   MIFALLQFEQAVFCPPKTLVVCSRMDLDAKRFPCRLAFYGVI---

cons              :*:******..*:.**:: ::.*::*:*.:  .*****:* *   


SPP00000092_1.0   THSSKYFQEELPKLRIFKRKQKVGSIQRVVNSSEVIVQNLFKDAK
PHYCAscaffold_1   --------------------------QGVVGS-------------

cons                                        * **.*             


SPP00000092_1.0   RDLYVGKNVELSTGEKGRIERTFGQTSKVAITFQDALSPETISNV
PHYCAscaffold_1   ---------------------------------------------

cons                                                           


SPP00000092_1.0   KNVKVLLNCKKYVFNKQAGLFQ
PHYCAscaffold_1   ---------------------S

cons                                   .