T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=98
*
 BAD AVG GOOD
*
contig_09_subse   :  98
gi|267844904|re   :  98
cons              :  98

contig_09_subse   MDDRSLKLAEDFVSARYIEAGRESLRATARIMRSILAQRCCPDEG
gi|267844904|re   MNRESFAAGERLVSPAYVRQGCEARRSHEHLIRLLLEKGKCPENG

cons              *: .*:  .* :**. *:. * *: *:  :::* :* :  **::*


contig_09_subse   LTDAAIELILRQLSLMDTNNLAHHVGGGEREGRVVSALVRMRHFH
gi|267844904|re   WDESTLELFLHELAIMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR

cons                ::::**:*::*::**:**:  : * *******.****  **::


contig_09_subse   LTHGIGRSGDLFSEQPKAAGSSLLYKITNVLMLDLIRQAGAPSTA
gi|267844904|re   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLDIIKLAGVHTVA

cons              : ********: : ********** **** *:**:*: **. :.*


contig_09_subse   AAVVVPMATGMTLALVLRCVAKTHATPRYVIWPRIDQKTALKCID
gi|267844904|re   NCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMI

cons               ..********:*:* :  : :.:...:*:********:.:*.: 


contig_09_subse   AAGLVPVPTPTSSSSLFLECHVDDVAAAVNAVGGPSQVVCVLSTT
gi|267844904|re   TAGFEPVVIENVLEGDELRTDLKAVEAKVQEL-GPDCILCIHSTT

cons              :**: **   .  ..  *. .:. * * *: : **. ::*: ***


contig_09_subse   SCFAPRLPDNTVAIAQYCKKAGIPYVVNNAYGVQSRRIMTRLDAA
gi|267844904|re   SCFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHIVNNAYGVQSSKCMHLIQQG

cons              ******:**.   :*  * : .**::********* : *  :: .


contig_09_subse   QRLGRVDFVVQSGDKNFLVPVGGSIICSGDKERCKAVAALYAGRA
gi|267844904|re   ARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNDSFIQEISKMYPGRA

cons               *:**:* .*** ****:*****:**.. :..  : :: :*.***


contig_09_subse   SMSPIVDLFITALSLGRRGMQTLWSDRYKCRARLIRQLRVFARER
gi|267844904|re   SASPSLDVLITLLSLGSNGYKKLLKERKEMFSYLSNQIKKLSEAY

cons              * ** :*::** **** .* :.* .:* :  : * .*:: ::.  


contig_09_subse   REVL-----------------------------------------
gi|267844904|re   NERLLHTPHNPISLAMTLKTLDEHRDKAVTQLGSMLFTRQVSGAR

cons              .* *                                         


contig_09_subse   ---------------------------------------------
gi|267844904|re   VVPLGSMQTVSGYTFRGFMSHTNNYPCAYLNAASAIGMKMQDVDL

cons                                                           


contig_09_subse   ---------------------------------------------
gi|267844904|re   FIKRLDRCLKAVRKERSKESDDNYDKTEDVDIEEMALKLDNVLLD

cons                                                           


contig_09_subse   ------L
gi|267844904|re   TYQDASS

cons