T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=96
*
 BAD AVG GOOD
*
gi|66814240|ref   :  96
supercont1.837_   :  96
cons              :  96

gi|66814240|ref   MNLKNLETCKGLIKGSYIDQAIQGTSQFNKLLETLLIHKKLPNIG
supercont1.837_   MNKPNYKLAEGLVPANYVRQAVESRNTRENLVKTVLSQRRLPVGG

cons              **  * : .:**: ..*: **::. .  ::*::*:* :::**  *


gi|66814240|ref   YNDKIIELILNEISLMDSNNFIENIGVGEREGRIYSGLVEKRHYG
supercont1.837_   WDDATIKLFLQDLSLMDSNNFNEYSGAGEREGRIESSLVRDMHNG

cons              ::*  *:*:*:::******** *  *.******* *.**.. * *


gi|66814240|ref   FAHGIGRSGDITEQQPKAAGSSLIQKLTHSLVLDAMKLAGLEQSS
supercont1.837_   MGHGIGRSGDISAHQPKAAGSSLMSKLTQYFMLEILKLSGATRT-

cons              :.*********: :*********:.***: ::*: :**:*  :: 


gi|66814240|ref   LSNCLLLPMATGMTLALTMLTLKSINANNKRYVLWPRIDQKSCLK
supercont1.837_   -KSCYVFPLATGMAVVMCLLALKAKNPT-ATHVVWPRIDQKTCLK

cons               ..* ::*:****::.: :*:**: *..   :*:*******:***


gi|66814240|ref   SIITAGLIPIVIPNQLDGDMIRTDLVAIEDKIKELG-VDNILCVF
supercont1.837_   AIVATGFIPVVIERPHTTDELRTDLPAIEDAIKRAGGPEKVLCVL

cons              :*:::*:**:** .    * :**** **** **. *  :::***:


gi|66814240|ref   STTSCFAPRVPDKIIEISEICKRYNIGHIINNAYGLQCSKILHNI
supercont1.837_   STTSCFAPRAFDKVSEIAVMCERLGIAHVVNNAYGVTSSLIMHHV

cons              *********. **: **: :*:* .*.*::*****: .* *:*::


gi|66814240|ref   SQACKLGRVDAFIQSTDKNFMVPVGGAIISGPNSEF-IDQISRNY
supercont1.837_   NEAMRLGRVDAYVQSTDKNFLVPVGGSVIAGPDKHLKVADVCKTY

cons              .:* :******::*******:*****::*:**:..: : ::.:.*


gi|66814240|ref   PGRANSSPILDVFITLLSMGKQGWLNLLKERKELLIYFNEQLSKF
supercont1.837_   PGRASGTPTLDVFITLLSMGSNGYKHRLLQRKEIYEILKQKMSEV

cons              ****..:* ***********.:*: : * :***:   :::::*:.


gi|66814240|ref   ALENNEKLLNTINENKISFALTLSSNNFNNNEEIISNNNNNNNNT
supercont1.837_   AAKHGERLLHTP-HNPISLAITITPRRRASSQTEVGDRDAQEPEN

cons              * ::.*:**:*  .* **:*:*::...  ..:  :.:.: :: :.


gi|66814240|ref   FSMIGSKLFSRSCSGSRVIDLKSNKKLLIGGLEFNNYGSHIDNYS
supercont1.837_   VTRLGAMLFRRGVSGARVVSADDVK--VVAGVSFKGYGAHADAYF

cons              .: :*: ** *. **:**:. .. *  ::.*:.*:.**:* * * 


gi|66814240|ref   TSYLTVACAIGITKLEIDTFIQRLSKLFNKK
supercont1.837_   TPYLTVAAALGMTRKDVEQVVERID-----K

cons              *.*****.*:*:*: ::: .::*:.     *