T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=87
*
 BAD AVG GOOD
*
Contig5166_subs   :  87
SECP43.HUMAN.gi   :  87
cons              :  87

Contig5166_subs   ---TLWVGDIEQWMDETYVMNLFSHVGEV-VNVKLIRDKNTMIPS
SECP43.HUMAN.gi   MAASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA

cons                 :**:**:* :***.:: . *: :**. :.**:**:: * **:


Contig5166_subs   GYGFVEFASHATAVKILENYNGTPIPNA--GRSFRLNWATMGAN-
SECP43.HUMAN.gi   GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQP

cons              ** *****. *** * *.: **.*:*.*  .: *:**:** * : 


Contig5166_subs   SNSNEFAIYIGDLSADVTDTVLQNAFIQRYPSVKNAKVVTDPVTG
SECP43.HUMAN.gi   DNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQ-TG

cons              .** *:::::***:.** * :* : *:: *** :..*** *  **


Contig5166_subs   ISKGYGFVRFIDENDKNRAMAEMQGQF-IGARPIRISGATPKSPM
SECP43.HUMAN.gi   VSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASR

cons              :*******:* ** :::**::* ** . :*::*:*:* * **:. 


Contig5166_subs   AKPAAASSSYNNHNNNYYP-YSYNHAPGSFNNSNYDYTSYYNN--
SECP43.HUMAN.gi   VKPVEYSQMYSYSYNQYYQQYQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQYG

cons              .**.  *. *.   *:**  *.  :*  .:::.. .*:  * :  


Contig5166_subs   ---------------------------------------------
SECP43.HUMAN.gi   YTQSTMQTYEEVGDDALEDPMPQLDVTEANKEFMEQSEELYDALM

cons                                                           


Contig5166_subs   -----------------Y
SECP43.HUMAN.gi   DCHWQPLDTVSSEIPAMM

cons