T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=89
*
 BAD AVG GOOD
*
Lt_contig3266_s   :  89
SECP43.HUMAN.gi   :  89
cons              :  89

Lt_contig3266_s   --ASIYVGDLDATINEPQLVELFKSFG-TILNVRVCRDIITQRSL
SECP43.HUMAN.gi   MAASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA

cons                **:::***:. ::*  : . * ::* *::.*:: *: :*  . 


Lt_contig3266_s   GYGYVNFDNHESAEKAIESMNFKRVGD----KCVRLMWQQRDPAL
SECP43.HUMAN.gi   GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQP

cons              ** :*:* :  :***.:..:* * : .    * .:* :   .   


Lt_contig3266_s   RYSGNGNVFVKNLEKDVDSKHLHDIFTKF-GAILSCKVMEDEEGK
SECP43.HUMAN.gi   DNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQTGV

cons                * : .:** :*  ***.  *:::*.*.  :  . **: *: * 


Lt_contig3266_s   SRGYGFVHFKDETSAKDAIVKMNGA--------------------
SECP43.HUMAN.gi   SKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRV

cons              *:*****:*.** . * *:.: :**                    


Lt_contig3266_s   ---------------------------------------------
SECP43.HUMAN.gi   KPVEYSQMYSYSYNQYYQQYQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQYGY

cons                                                           


Lt_contig3266_s   ---------------------------------------------
SECP43.HUMAN.gi   TQSTMQTYEEVGDDALEDPMPQLDVTEANKEFMEQSEELYDALMD

cons                                                           


Lt_contig3266_s   -----------------
SECP43.HUMAN.gi   CHWQPLDTVSSEIPAMM

cons