T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=81
*
 BAD AVG GOOD
*
contig_35_subse   :  81
SECP43.HUMAN.gi   :  81
cons              :  81

contig_35_subse   --ASIYVGDLDAAINEPQLVELFKPFG-TILNVRVCRDIITQRSL
SECP43.HUMAN.gi   MAASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA

cons                **:::***:. ::*  : . * .:* *::.*:: *: :*  . 


contig_35_subse   GYGYVNFDNHDSAEKAIESMNFKRVGD----KCVRLMWQQRDPAL
SECP43.HUMAN.gi   GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQP

cons              ** :*:* :  :***.:..:* * : .    * .:* :   .   


contig_35_subse   RYSGNGNVFVKNLEKDVDSKSLHDIFTK-FGSILSCKVMQDEEGK
SECP43.HUMAN.gi   DNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQTGV

cons                * : .:** :*  ***.  *:::*.* : *  . **: *: * 


contig_35_subse   SRGYGFVHFKDETSAKDAIVKMNGAADHASEPRRGKATRSR-FTY
SECP43.HUMAN.gi   SKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRV

cons              *:*****:*.** . * *:.: :**.. .*:* * ..: .:    


contig_35_subse   KPISRSE--------------------------------------
SECP43.HUMAN.gi   KPVEYSQMYSYSYNQYYQQYQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQYGY

cons              **:. *:                                      


contig_35_subse   ------------------------AAAARVSLVEQSNFF------
SECP43.HUMAN.gi   TQSTMQTYEEVGDDALEDPMPQLDVTEANKEFMEQSEELYDALMD

cons                                      .: *. .::***: :      


contig_35_subse   ---------------LQ
SECP43.HUMAN.gi   CHWQPLDTVSSEIPAMM

cons                             :