T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=86
*
 BAD AVG GOOD
*
scaffold_11_sub   :  86
SECP43.HUMAN.gi   :  86
cons              :  86

scaffold_11_sub   -SASLYVGDLATDANEALLFEIFNAVGP-VASIRVCRDAVTRRSL
SECP43.HUMAN.gi   MAASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA

cons               :***::*** .  :* :: . * ::*  * *::: *: :*  . 


scaffold_11_sub   GYAYVNYHQLSDAERALDTMNKEDEDDATEKKTEESPEASEGKET
SECP43.HUMAN.gi   GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQP

cons              **.:*:: :*: **:.*..:* :   .**  *  :   *: **:.


scaffold_11_sub   DEPKGVNLYVKNLEDVVTDDMLRDEFAAM-GTITSARIMKDMGKD
SECP43.HUMAN.gi   DNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLD--QT

cons              *:.   .*:* :*   * *.** : *. :  :  ..::: *  : 


scaffold_11_sub   GRSRGFGFVCFSSPEEATRAVNEMNGKL-IANKPIFVALAQRREV
SECP43.HUMAN.gi   GVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKAS

cons              * *:*:*** *:.  * .**:.* :* : :..**: :::*  :  


scaffold_11_sub   RRAQLEAQHANRNQQQQQQQQPYGYQAQGGYQQQ--------PQY
SECP43.HUMAN.gi   RVKPVEYSQMYSYSYNQYYQQYQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQY

cons              *   :* .:    . :*  **  .* ** **:*:        ***


scaffold_11_sub   GQGSY----------------------------------------
SECP43.HUMAN.gi   GYTQSTMQTYEEVGDDALEDPMPQLDVTEANKEFMEQSEELYDAL

cons              *  .                                         


scaffold_11_sub   -----------------GQ
SECP43.HUMAN.gi   MDCHWQPLDTVSSEIPAMM

cons