T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=97
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 BAD AVG GOOD
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T.congo.pschr.1   :  97
OPtRNAsecSTHuma   :  97
cons              :  97

T.congo.pschr.1   MDERALHLAESIVEPRYIQAGVESQRSVERTVRSILAQRRCPDEG
OPtRNAsecSTHuma   MNRESFAAGERLVSPAYVRQGCEARRSHEHLIRLLLEKGKCPENG

cons              *:..::  .* :*.* *:: * *::** *: :* :* : :**::*


T.congo.pschr.1   LNDCAIELLLHQIAMMDTNNFTAHVGAGEREGRVASTLVQRRYYN
OPtRNAsecSTHuma   WDESTLELFLHELAIMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR

cons               ::.::**:**::*:**:*** .: *.*********:** **:*.


T.congo.pschr.1   LTHGVGRSGDICSDQPKAAGSSLLYKLTNHMVLDLLRQAGTPSLA
OPtRNAsecSTHuma   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLDIIKLAGVHTVA

cons              : **:******.: ********** *:** :***::: **. ::*


T.congo.pschr.1   SAAVIPMATGMTISLVLRSIAHHRDPPRFVIWTRVDQKTALKCIE
OPtRNAsecSTHuma   NCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMI

cons              .. *:******:::* : :: *:*  .:::**.*:***:.:*.: 


T.congo.pschr.1   LSGFIPVVVPLRRASVFLQAHVDDVAASIERVGGPTNVLCVLSTT
OPtRNAsecSTHuma   TAGFEPVVIENVLEGDELRTDLKAVEAKVQEL-GPDCILCIHSTT

cons               :** ***:     .  *::.:. * *.::.: **  :**: ***


T.congo.pschr.1   SCFAPH-------------------------RVQSRSIMQRIDAA
OPtRNAsecSTHuma   SCFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHIVNNAYGVQSSKCMHLIQQG

cons              *****:                          *** . *: *: .


T.congo.pschr.1   IRLGRVDAIVQSGDKNFLVPVGGAVLSGGRTE-VARATSLYAGRA
OPtRNAsecSTHuma   ARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNDSFIQEISKMYPGRA

cons               *:**:**:*** ****:******:::* . . : . :.:*.***


T.congo.pschr.1   SASPVVDLFITALSLGRSGFQRLWDARYFLRELLEQRLRDFARAR
OPtRNAsecSTHuma   SASPSLDVLITLLSLGSNGYKKLLKERKEMFSYLSNQIKKLSEAY

cons              **** :*::** **** .*:::* . *  : . *.::::.::.* 


T.congo.pschr.1   EETL-----------------------------------------
OPtRNAsecSTHuma   NERLLHTPHNPISLAMTLKTLDEHRDKAVTQLGSMLFTRQVSGAR

cons              :* *                                         


T.congo.pschr.1   ---------------------------------------------
OPtRNAsecSTHuma   VVPLGSMQTVSGYTFRGFMSHTNNYPCAYLNAASAIGMKMQDVDL

cons                                                           


T.congo.pschr.1   ---------------------------------------------
OPtRNAsecSTHuma   FIKRLDRCLKAVRKERSKESDDNYDKTEDVDIEEMALKLDNVLLD

cons                                                           


T.congo.pschr.1   ------L
OPtRNAsecSTHuma   TYQDASS

cons