T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=98
*
 BAD AVG GOOD
*
supercont1.837_   :  98
OPtRNAsecSTHuma   :  98
cons              :  98

supercont1.837_   MNKPNYKLAEGLVPANYVRQAVESRNTRENLVKTVLSQRRLPVGG
OPtRNAsecSTHuma   MNRESFAAGERLVSPAYVRQGCEARRSHEHLIRLLLEKGKCPENG

cons              **: .:  .* **.. ****. *:*.::*:*:: :*.: : * .*


supercont1.837_   WDDATIKLFLQDLSLMDSNNFNEYSGAGEREGRIESSLVRDMHNG
OPtRNAsecSTHuma   WDESTLELFLHELAIMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR

cons              **::*::***::*::******   .*.******: *:**   *  


supercont1.837_   MGHGIGRSGDISAHQPKAAGSSLMSKLTQYFMLEILKLSGATRTK
OPtRNAsecSTHuma   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLDIIKLAGVHTVA

cons              : *********** *********:.*:*: ::*:*:**:*.  . 


supercont1.837_   SCYVFPLATGMAVVMCLLALKAKNPTATHVVWPRIDQKTCLKAIV
OPtRNAsecSTHuma   NCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMI

cons              .*:*.*:****::.:*:*:*: *.*.*.:::*******:*:*:::


supercont1.837_   ATGFIPVVIENITEDNELRTDLPAIEDAIKRAGGPEKVLCVLSTT
OPtRNAsecSTHuma   TAGFEPVVIENVLEGDELRTDLKAVEAKVQEL-GPDCILCIHSTT

cons              ::** ******: *.:****** *:*  ::.  **: :**: ***


supercont1.837_   SCFAPRAFDKVSEIAVMCERLGIAHVVNNAYGVTSSLIMHHVNEA
OPtRNAsecSTHuma   SCFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHIVNNAYGVQSSKCMHLIQQG

cons              ******. *::.*:**:* . .*.*:******* **  ** :::.


supercont1.837_   MRLGRVDAYVQSTDKNFLVPVGGSVIAGPDKHLKVADVCKTYPGR
OPtRNAsecSTHuma   ARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNDSF-IQEISKMYPGR

cons               *:**:**:*** ****:*****::*** :. : : ::.* ****


supercont1.837_   ASGTPTLDVFITLLSMGSNGYKHRLLQRKEIYEILKQKMSEVAAK
OPtRNAsecSTHuma   ASASPSLDVLITLLSLGSNGYKKLLKERKEMFSYLSNQIKKLSEA

cons              **.:*:***:*****:******: * :***::. *.:::.:::  


supercont1.837_   HGERLLHTPHNPISLAITITPRRRASSQNVTRLGAMLFRRGVSGA
OPtRNAsecSTHuma   YNERLLHTPHNPISLAMTLKTLDEHRDKAVTQLGSMLFTRQVSGA

cons              :.**************:*:..  .  .: **:**:*** * ****


supercont1.837_   RVVSADDVKVVAGVSFKGYGAHADAYFTPYLTVAAALGMTRKDVE
OPtRNAsecSTHuma   RVVPLGSMQTVSGYTFRGFMSHTNNYPCAYLNAASAIGMKMQDVD

cons              ***. ..::.*:* :*:*: :*:: *  .**..*:*:**. :**:


supercont1.837_   QVVERIDKT------------------------------------
OPtRNAsecSTHuma   LFIKRLDRCLKAVRKERSKESDDNYDKTEDVDIEEMALKLDNVLL

cons               .::*:*:                                     


supercont1.837_   -------L
OPtRNAsecSTHuma   DTYQDASS

cons