T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=70
*
 BAD AVG GOOD
*
SPP00000116_1.0   :  70
Lt_contig1348.p   :  70
cons              :  70

SPP00000116_1.0   MRLLLLLLVAASAVVRSEASANLGGVPSKRLKMQYATGPLLKFQI
Lt_contig1348.p   ---------------------------------------------

cons                                                           


SPP00000116_1.0   CVSUGYRRVFEEYMRVISQRYP---DIRIEGENYLPQPIYRHI-A
Lt_contig1348.p   ----GYAKYFEDMKQQLQRMLPNAEDVRIVGGTY-PTPPARALAA

cons                  ** : **:  : :.:  *   *:** * .* * *  * : *


SPP00000116_1.0   SFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMM
Lt_contig1348.p   KMCSTAFLASLGVALAGQQ-LVFLP---PTALNFIAQQRG-LLIG

cons              .: *.  *. :*: :.*:: :.*:    *:  ::  :::    : 


SPP00000116_1.0   VFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQI
Lt_contig1348.p   AGFLLNMVGSALSQTGAFEVTLDGELIFSKLQAGAVPTAAEIRHI

cons              . ** **: .   .*****:**:.  ::***::* :*:  :: :*


SPP00000116_1.0   LDNEMKLNVHMDSIPHHRS
Lt_contig1348.p   ------------------V

cons