T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=95
*
 BAD AVG GOOD
*
SPP00000116_1.0   :  95
scaffold_11_sub   :  95
cons              :  95

SPP00000116_1.0   MRLLLLLLVAASAVVRSEASANLGGVPSKRLKMQYATGPLLKFQI
scaffold_11_sub   ---------------------------------------------

cons                                                           


SPP00000116_1.0   CVSUGYRRVFEEYMRVISQRYPDIR--IEGENYLPQPIYRHIASF
scaffold_11_sub   ----GSKRNFLQVRDWLEQTFPELRGKVTGDNYPPPPIAELLMKF

cons                  * :* * :    :.* :*::*  : *:** * ** . : .*


SPP00000116_1.0   LSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWG--QENKVYACMM
scaffold_11_sub   LSVIQLAGMAVALIGENVFRFIGMSRPPSWYGDIVVKNAVPLGIG

cons              ***::*. :.: ::*:: * *:**. *. *  .   :* *   : 


SPP00000116_1.0   VFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDV-PVWSKLESGHLPSMQQLVQ
scaffold_11_sub   LYLIVPQILNGYIVSNAFEVVLDGTETIFSKIATGRMPAAEDLID

cons              ::::   * *  : :.***:.*:.. .::**: :*::*: ::*::


SPP00000116_1.0   ILDNEMKLNVHMDSIPHHRS
scaffold_11_sub   P------------------L

cons