T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=89
*
 BAD AVG GOOD
*
SPP00000116_1.0   :  89
Cf_Contig1035_s   :  89
cons              :  89

SPP00000116_1.0   MRLLLLLLVAASAVVRSEASANLGGVPSKRLKMQYATGPLLKFQI
Cf_Contig1035_s   ---------------------------------------------

cons                                                           


SPP00000116_1.0   CVSUGYRRVFEEYMRVISQRYP---DIRIEGENYLPQPIYRHIAS
Cf_Contig1035_s   ----GYAKYFDEMKQHLQRSLPNAQEVRIVGGTYPTPPLRAAVAK

cons                  ** : *:*  : :.:  *   ::** * .* . *:   :*.


SPP00000116_1.0   FLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMV
Cf_Contig1035_s   ACSFSFMGALGLALAGPQ----LGILPPVIVNFLNQQRGM-VIGA

cons                *.  :  :** :.* :    :*: .* * :: ::::    : .


SPP00000116_1.0   FFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQIL
Cf_Contig1035_s   GFLLNIVGNSLVQTGAFEVSLDGTLIFSKLQTGSVPPVAEVRRII

cons               ** *:: *. :.*****::*:.. ::***::* :*.: :: :*:


SPP00000116_1.0   DNEMKLNVHMDSIPHHRS
Cf_Contig1035_s   IEKTLLEQYGD------S

cons               ::  *: : *      *