T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=93
*
 BAD AVG GOOD
*
SPP00000059_1.0   :  93
scaffold_21_sub   :  93
cons              :  93

SPP00000059_1.0   MTTKKFRMEDVGLSKLKVEKNPKDVKQTEWKSVLPNEVYRVARES
scaffold_21_sub   ----------------------------EWKSTLTTRQYNILRTG

cons                                          ****.*... *.: * .


SPP00000059_1.0   GTETPHTGGFNDHFEKGRYVCLCCGSELFNSDAKFWAGCGWPAFS
scaffold_21_sub   GTEQQYSSVLEAEERTGTYNCAGCSTPLFLSKEKFHSGTGWPSFA

cons              ***  ::. :: . ..* * *  *.: ** *. ** :* ***:*:


SPP00000059_1.0   ES-VGQDANIVRIVDRSHGMHRTEVRCKTCDAHLGHVFNDG----
scaffold_21_sub   SALVGVEVEKKNMLAATLG--GSEVRCKNCGGHMGDLFNDGYIFP

cons              .: ** :.:  .::  : *   :*****.*..*:*.:****    


SPP00000059_1.0   --PKETTGERYCINSVCMAFEKKD
scaffold_21_sub   GTPAEKTGKRFCIDGVALNF---K

cons                * *.**:*:**:.*.: *   .