T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=97
*
 BAD AVG GOOD
*
scaffold_2_subs   :  97
gi|267844904|re   :  97
cons              :  97

scaffold_2_subs   ---------------------------------------------
gi|267844904|re   MNRESFAAGERLVSPAYVRQGCEARRSHEHLIRLLLEKGKCPENG

cons                                                           


scaffold_2_subs   ------------------------CGVGEREGRVFSSLVSQRHYG
gi|267844904|re   WDESTLELFLHELAIMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR

cons                                      ********** *:**::*** 


scaffold_2_subs   LSHGMGRSGDITEPQPKAAGSSALVKLALLLTLDALRRGSKLDAK
gi|267844904|re   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLDII----KLAGV

cons              : **:******:  ******** * *::  *.** :    ** . 


scaffold_2_subs   GPAAYGILLPLCTGMSISLLLASIRSKEENSETKKDIVLWSRIDQ
gi|267844904|re   HTVANCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRP----KAKYIIWPRIDQ

cons               ..*  :::*:.****::* : ::* *.     * . ::*.****


scaffold_2_subs   KSCFKAIHSAGLICVVVPTKIEGDEVITDIDAMEAALSKH-EGRV
gi|267844904|re   KSCFKSMITAGFEPVVIENVLEGDELRTDLKAVEAKVQELGPDCI

cons              *****:: :**:  **: . :****: **:.*:** :.:   . :


scaffold_2_subs   LAVITTSSCFTPRVPDAVDKVAKLCKVSNVYHIINNAYGLQCAKT
gi|267844904|re   LCIHSTTSCFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHIVNNAYGVQSSKC

cons              *.: :*:***:***** ::::* :*   :: **:*****:*.:* 


scaffold_2_subs   SKLINRACVVGRVDAVVCSTDKNFLVPVGGAIIISPSKNIIGEVG
gi|267844904|re   MHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNDSFIQEIS

cons               :**::.. ***:**.* * ****:******** . ...:* *:.


scaffold_2_subs   KVYAGRASSSPIVDLFITLLSMGMNGYKRLLKERTSVLETFPERL
gi|267844904|re   KMYPGRASASPSLDVLITLLSLGSNGYKKLLKERKEMFSYLSNQI

cons              *:*.****:** :*::*****:* ****:*****..::. :.:::


scaffold_2_subs   REVAEKHGERILVCPNNTVSFGLTLDGLARPKAKEITSFGAMLFS
gi|267844904|re   KKLSEAYNERLLHTPHNPISLAMTLKTLDEHRDKAVTQLGSMLFT

cons              ::::* :.**:*  *:*.:*:.:**. * . : * :*.:*:***:


scaffold_2_subs   RCVSGTRVVPRSQLKSIGGQDFIGFGSSTNEYPHAYMTAACAIGV
gi|267844904|re   RQVSGARVVPLGSMQTVSGYTFRGFMSHTNNYPCAYLNAASAIGM

cons              * ***:**** ..::::.*  * ** * **:** **:.**.***:


scaffold_2_subs   SIFEIEEFYVRLDKTLTEFKRKKKKK-------------------
gi|267844904|re   KMQDVDLFIKRLDRCLKAVRKERSKESDDNYDKTEDVDIEEMALK

cons              .: ::: *  ***: *. .::::.*:                   


scaffold_2_subs   -------------A
gi|267844904|re   LDNVLLDTYQDASS

cons                           :