T-COFFEE, Version_8.99(Fri Feb 18 08:27:45 CET 2011 - Revision 596)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=96
*
 BAD AVG GOOD
*
PHYCAscaffold_1   :  97
SPP00000092_1.0   :  95
cons              :  96

PHYCAscaffold_1   --LNVNVGVLGHVDSGKTSLVRALSTQLSTAAL
SPP00000092_1.0   MPINFNIGLLGHVDSGKTTLAKALSSISSTAAF

cons                :*.*:*:*********:*.:***:  ****:


PHYCAscaffold_1   DKHPQSQQRGITLDLGFSSFLLKPSAQVK--PC
SPP00000092_1.0   DKNPQSVERGITLDLGFSGLLVDAPAHLPQGEQ

cons              **:*** :**********.:*:...*::     


PHYCAscaffold_1   LQVTLVDCPGHASLFRTILGGVAIIDTVLLVID
SPP00000092_1.0   LQFTFVDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMLLVVD

cons              **.*:*********:***:**. *** :***:*


PHYCAscaffold_1   CRKGLQAQTIESLLLATLIAKRSVVVALTKTDL
SPP00000092_1.0   AQKGKQTQTAECLIIGELLQKKLI-VVINKIDV

cons              .:** *:** *.*::. *: *: : *.:.* *:


PHYCAscaffold_1   VPSAERDNV-----------------IGKVPVA
SPP00000092_1.0   YPENQRASKLEKLRLRLAKTLEATTFGGQVPIC

cons               *. :* .                   *:**:.


PHYCAscaffold_1   VGSNQDPQGIPQLLEALNANLQVPERDHSGSFC
SPP00000092_1.0   AVSALQGTHIAELREVLREAYFQPQRNLADPLF

cons              . *  :   *.:* *.*.     *:*: :..: 


PHYCAscaffold_1   LAVDHCFSVPGNGTILTGTVLSGALERGDELEL
SPP00000092_1.0   MYVDHCFGIKGQGTVCTGTLLQGKVQVNNVIEL

cons              : *****.: *:**: ***:*.* :: .: :**


PHYCAscaffold_1   LPLGAKVKVKTLQVFKKDVAKCSQGDRVGLRVN
SPP00000092_1.0   PALGEQRKVKSIQMFRKNVTSASMGDRIGLCVT

cons               .** : ***::*:*:*:*:..* ***:** *.


PHYCAscaffold_1   GLDPALVERALAVSPPGSLTPVTQVVIPVTKVP
SPP00000092_1.0   QFNAKLLERGI-ITQPGYLKPIYAVCLQFKPIR

cons               ::. *:**.: :: ** *.*:  * : .. : 


PHYCAscaffold_1   FFHEISCKSGGKCHVTVGHTTIIAMATFFTCLG
SPP00000092_1.0   YYKEV-IKSMRKMHISVGHNTVMANVTLFRDT-

cons              :::*:  **  * *::***.*::* .*:*    


PHYCAscaffold_1   GDKGDETGFNPSALYEYVEELSDEKEAEEGMIF
SPP00000092_1.0   --DGTTSTFQLDKEYEYMEDVQPAEVQHNDVIY

cons                .*  : *: .  ***:*::.  :  .:.:*:


PHYCAscaffold_1   ALLQFEQAVFCPPKTLVVCSRMDLDAKRFPCRL
SPP00000092_1.0   ALLQFESPVLSPPHSTLIASKLDMDVHSTSCRL

cons              ******..*:.**:: ::.*::*:*.:  .***


PHYCAscaffold_1   AFYGVI---------------------------
SPP00000092_1.0   AFWGRIAWQTHSSKYFQEELPKLRIFKRKQKVG

cons              **:* *                           


PHYCAscaffold_1   --QGVVGS-------------------------
SPP00000092_1.0   SIQRVVNSSEVIVQNLFKDAKRDLYVGKNVELS

cons                * **.*                         


PHYCAscaffold_1   ---------------------------------
SPP00000092_1.0   TGEKGRIERTFGQTSKVAITFQDALSPETISNV

cons                                               


PHYCAscaffold_1   ---------------------S
SPP00000092_1.0   KNVKVLLNCKKYVFNKQAGLFQ

cons                                   .