T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=65
*
 BAD AVG GOOD
*
A.franciscana   :  69
D.rerio         :  70
H.sapiens_W1    :  69
H.sapiens_W2    :  74
M.musculus_W1   :  26
M.musculus_W2   :  74
cons            :  65

A.franciscana   M---------------------VKIHVEYCGAXGYAPRYQELAAK
D.rerio         MT--------------------VKVHVVYCGGUGYRPKFIKLKTL
H.sapiens_W1    MA--------------------LAVRVVYCGAUGYKSKYLQLKKK
H.sapiens_W2    MSGEPGQTSVAPPPEEVEPGSGVRIVVEYCEPCGFEATYLELASA
M.musculus_W1   LCD--------------------VEPQEWCL--------------
M.musculus_W2   MSGEPAPVSVVPPPGEVEAGSGVHIVVEYCKPCGFEATYLELASA

cons            :                           :*               


A.franciscana   IRKAAPD-----AEV--SGNVGRRSSFE---VTVNGELIHS-KLS
D.rerio         LEDEFPNE----LEITGEGTPSTTGWLE---VEVNGKLVHS-KKN
H.sapiens_W1    LEDEFPGR----LDICGEGTPQATGFFE---VMVAGKLIHS-KKK
H.sapiens_W2    VKEQYPG-----IEI--ESRLGGTGAFE---IEINGQLVFS-KLE
M.musculus_W1   -----PDMELWPRDLTGLGMVREKNFSTLTPLTLRRDLIIISLPT
M.musculus_W2   VKEEYPG-----IEI--ESRLGGTGAFE---IEINGQLVFS-KLE

cons                 *.      ::   .     .      : :  .*:      


A.franciscana   TNGFPDFDEVVEIVISVTKGDKPRTVEKTHSSC-II
D.rerio         GDGFVDSDSKMQKIVTAIEQ------------AMGK
H.sapiens_W1    GDGYVDTESKFLKLVAAIKA-----------ALAQG
H.sapiens_W2    NGGFPYEKDLIEAIRRASNGETLEKITNSRPPCVIL
M.musculus_W1   LNSWTHFLAVLKMKRLMWTGQ-----------WKRS
M.musculus_W2   NGGFPYEKDLMEAIRRASNGEPVEKITNSRPPCVIL

cons             ..:      .