T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=74
*
 BAD AVG GOOD
*
P.tricornutum   :  63
A.franciscana   :  76
D.rerio         :  77
H.sapiens_W1    :  76
H.sapiens_W2    :  77
M.musculus_W2   :  77
cons            :  74

P.tricornutum   SQTKS-----------TMGANKLRIQVQYXGGXGYGRYFNGLKDF
A.franciscana   M---------------------VKIHVEYCGAXGYAPRYQELAAK
D.rerio         M--------------------TVKVHVVYCGGXGYRPKFIKLKTL
H.sapiens_W1    M--------------------ALAVRVVYCGAUGYKSKYLQLKKK
H.sapiens_W2    MSGEPGQTSVAPPPEEVEPGSGVRIVVEYCEPCGFEATYLELASA
M.musculus_W2   MSGEPAPVSVVPPPGEVEAGSGVHIVVEYCKPCGFEATYLELASA

cons                                  : : * *    *:   :  *   


P.tricornutum   LSSQPSVANKIELVGKEDPTVTGNFEVSVAATGQLLHSKRQAGQG
A.franciscana   IRKA--APD-AEV--SGNVGRRSSFEVTV--NGELIHSKLSTN-G
D.rerio         LEDE--FPNELEITGEGTPSTTGWLEVEV--NGKLVHSKKNGD-G
H.sapiens_W1    LEDE--FPGRLDICGEGTPQATGFFEVMV--AGKLIHSKKKGD-G
H.sapiens_W2    VKEQ--YPG-IEI--ESRLGGTGAFEIEI--NGQLVFSKLENG-G
M.musculus_W2   VKEE--YPG-IEI--ESRLGGTGAFEIEI--NGQLVFSKLENG-G

cons            : .    ..  ::  .      . :*: :   *:*:.** . . *


P.tricornutum   KATSP-----------GERAAILEQI-KE-L-LD
A.franciscana   FPDFDEVVEIVISVTKGDKPRTVEKTH-SSC-II
D.rerio         FVDSDSKMQ-----------KIVTAI-EQAM-GK
H.sapiens_W1    YVDTESKFL-----------KLVAAI-KAALAQG
H.sapiens_W2    FPYEKDLIEAIRRASNGETLEKITNSRPPCV-IL
M.musculus_W2   FPYEKDLMEAIRRASNGEPVEKITNSRPPCV-IL

cons                                  :