T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=84
*
 BAD AVG GOOD
*
T.trahens       :  83
A.franciscana   :  84
D.rerio         :  83
H.sapiens_W1    :  82
H.sapiens_W2    :  86
M.musculus_W2   :  86
cons            :  84

T.trahens       ------------------------IHIEYCTSXGYSGRYRQVARA
A.franciscana   M---------------------VKIHVEYCGAXGYAPRYQELAAK
D.rerio         MT--------------------VKVHVVYCGGXGYRPKFIKLKTL
H.sapiens_W1    MA--------------------LAVRVVYCGAUGYKSKYLQLKKK
H.sapiens_W2    MSGEPGQTSVAPPPEEVEPGSGVRIVVEYCEPCGFEATYLELASA
M.musculus_W2   MSGEPAPVSVVPPPGEVEAGSGVHIVVEYCKPCGFEATYLELASA

cons                                    : : **   *:   : ::   


T.trahens       ITTAFPD-VVVRGNELARPRRGAFEI-------------------
A.franciscana   IRKAAPD-AEVSGN---VGRRSSFEVTVNGELIHSKLSTNGFPDF
D.rerio         LEDEFPNELEITG-EGTPSTTGWLEVEVNGKLVHSKKNGDGFVDS
H.sapiens_W1    LEDEFPGRLDICG-EGTPQATGFFEVMVAGKLIHSKKKGDGYVDT
H.sapiens_W2    VKEQYPG-IEI---ESRLGGTGAFEIEINGQLVFSKLENGGFPYE
M.musculus_W2   VKEEYPG-IEI---ESRLGGTGAFEIEINGQLVFSKLENGGFPYE

cons            :    *.   :          . :*:                   


T.trahens       ----------------------------T
A.franciscana   DEVVEIVISVTKGDKPRTVEKTHSSC-II
D.rerio         DSKMQKIVTAIE-----------QA-MGK
H.sapiens_W1    ESKFLKLVAAIK-----------AALAQG
H.sapiens_W2    KDLIEAIRRASNGETLEKITNSRPPCVIL
M.musculus_W2   KDLMEAIRRASNGEPVEKITNSRPPCVIL

cons