T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=75
*
 BAD AVG GOOD
*
H.sapiens    :  75
B.taurus     :  76
M.musculus   :  74
cons         :  75

H.sapiens    MNNQARTPAPSSARTSTSVRAST------------------PTRTPTP
B.taurus     MNNQPRTPAPTPARASTPVRGSTLHRTSIQVRTPTPGPDSGPTRITTL
M.musculus   MNNKARVPAPSSVRANTPARTPA-------------------------

cons         ***:.*.***:..*:.*..* .:                         


H.sapiens    LRTPTPVRTRTPIRTLTPVLTPSPAGTSPLVLTPAPAQIPTLVPTPAL
B.taurus     LRTPALIRTLTPIRTPTPVRTPTPVPPSTPVRSPIPVRTPTPVPPSTP
M.musculus   -----------PIRTATPVRAPNPAHNSTPVRTSIRVRAPAQVPNPVP

cons                    **** *** :*.*.  *. * :.  .: *: ** .. 


H.sapiens    ARIPRLVPPPAPAWIPTPVPTPVPVR------NPTPVPTPARTLTP-P
B.taurus     VRTPTPVPLSTPVRPPTPVRPPTPVRPPTPVRPPTPIGTPTLIRSPTP
M.musculus   IRFPTPAPVPAPTLTPA--PTPAPVRHAAPVRTPAPVRAPNLGR----

cons          * *  .* .:*.  *:   .*.***       *:*: :*        


H.sapiens    VRVPAPAPAQLLAGIRAALPVLDSYLAPALPLDPPPEPAPELPLLPEE
B.taurus     VQIPIPEPIPTPIPSRVLIPPLESFPDSALPSGPPLELEPTLTVSPAK
M.musculus   --------------VFPKISPGRFFPSLASPTAQPLSSRAA----SAL

cons                           :.    :   * *   * .  .     .  


H.sapiens    DPEPAPSLKLIPS-----VSSE---AGPAPGPLPTRTPLAANSPGPTL
B.taurus     NLEPSPAKNLEPSPRVKQVSSAANGFPPIQEPLPALTPLATDLRSPSL
M.musculus   LKDPTLAQNQKPS-----IHSL---AEAIQGPLPVLTPSSSKTQGSIP

cons           :*: : :  **     : *      .   ***. ** ::.  ..  


H.sapiens    D--FTFRADPSAIGLADPPIP---SPVP-----------SPILGTIPS
B.taurus     G--SPLRTDTSTTNLIASSSGHVPG--------------TPILGAIQA
M.musculus   DTASPIDSLAS-TAMASSTLGPIPGPNPTLEFLASPLKETPGLGKLST

cons         .   .: : .*   :  ..     .              :* ** : :


H.sapiens    AISLQ--NCTETFPSSSENFALDKRVLIRVTYCGLUSYSLRYILLKKS
B.taurus     ILPVP----ATALASISGNLKEENKIMIRVVYCGLUSYSLRYILLRKS
M.musculus   ISPAPSFGSTKEIPSTSEDVPTPNRILIRVMYCGLUSYGLRYIILKRT

cons           .      :  :.* * :.   ::::*** *******.****:*:::


H.sapiens    LEQQFPNHLLFEEDRAAQATGEFEVFVNGRLVHSKKRGDGFVNESRLQ
B.taurus     LEQQFPNSLIFEEEISAQATGEFEVFVDGKLIHSKKNGDGFVDEVKLQ
M.musculus   LEHQFPNLLEFEEERATQVTGEFEVFVDGKLIHSKKKGDGFVDESGLK

cons         **:**** * ***: ::*.********:*:*:****.*****:*  *:


H.sapiens    KIVSVIDEEIKK----R
B.taurus     TIVNLLNEEFKKKVAGN
M.musculus   KLVGAIDEEIKK----R

cons         .:*. ::**:**    .