T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
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SCORE=92
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 BAD AVG GOOD
*
P.ultimum        :  91
D.melanogaster   :  93
H.sapiens        :  92
cons             :  92

P.ultimum        -----VNVNVGVLGHVDSGKTSLVRVLSTQLSTAALDKHPQSQQR
D.melanogaster   M---PINFNIGLLGHVDSGKTTLAKALSSISSTAAFDKNPQSVER
H.sapiens        MAGRRVNVNVGVLGHIDSGKTALARALSTTASTAAFDKQPQSRER

cons                  :*.*:*:***:*****:*.:.**:  ****:**:*** :*


P.ultimum        GITLDLGFSAFRVPHEQLIKDGS----------AAIENTDIQITL
D.melanogaster   GITLDLGFSGLLVDAPAHLP----------------QGEQLQFTF
H.sapiens        GITLDLGFSCFSVPLPARLRSSLPEFQAAPEAEPEPGEPLLQVTL

cons             ********* : *     :                     :*.*:


P.ultimum        VDCPGHASLFKTILGGARIIDMVLLVVDAQKGLQPQTIESLLVAE
D.melanogaster   VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMLLVVDAQKGKQTQTAECLIIGE
H.sapiens        VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMMLVIDVTKGMQTQSAECLVIGQ

cons             *********::**:***:***:::**:*. ** *.*: *.*::.:


P.ultimum        LAVAHHVVIALNKVDLLLPESEREVRIRSLETEIQRVLDAKFPRL
D.melanogaster   LLQ-KKLIVVINKIDV-YPENQRASKLEKLRLRLAKTLEAT--TF
H.sapiens        IAC-QKLVVVLNKIDL-LPEGKRQAAIDKMTKKMQKTLENT--KF

cons             :   :::::.:**:*:  **.:*   : .:  .: :.*: .   :


P.ultimum        RGQNVPIVAVAAAPA----------VGISTLVETIRSHLYLPERN
D.melanogaster   GG-QVPICAVSALQG----------THIAELREVLREAYFQPQRN
H.sapiens        RG--APIIPVAAKPGGPEAPETEAPQGIPELIELLTSQISIPTRD

cons              *  .** .*:*  .            *. * * : .    * *:


P.ultimum        PTGPFSLAIDHCFAIQGNGTILTGTVLSGSVKVNDEVEIPSLQVV
D.melanogaster   LADPLFMYVDHCFGIKGQGTVCTGTLLQGKVQVNNVIELPALGEQ
H.sapiens        PSGPFLMSVDHCFSIKGQGTVMTGTILSGSISLGDSVEIPALKVV

cons              :.*: : :****.*:*:**: ***:*.*.:.:.: :*:*:*   


P.ultimum        KKVKSMQMFKQSVTSATQGDRVAIRVNGLDASLVERGMAITPHSM
D.melanogaster   RKVKSIQMFRKNVTSASMGDRIGLCVTQFNAKLLERGIITQPGYL
H.sapiens        KKVKSMQMFHMPITSAMQGDRLGICVTQFDPKLLERGLVCAPESL

cons             :****:***:  :***  ***:.: *. ::..*:***:   *  :


P.ultimum        PYVTQVVVPVHQIAFFQGTCKSGAKFHATINHTTVVAIATFFSPM
D.melanogaster   KPIYAVCLQFKPIRYYKEVIKSMRKMHISVGHNTVMANVTLFRDT
H.sapiens        HTVHAALISVEKIPYFRGPLQTKAKFHITVGHETVMGRLMFFSPA

cons               :  . : .. * :::   ::  *:* ::.* **:.   :*   


P.ultimum        HGAKFT---TKTQFEPLRLYEYVA-----QIEPIADANSG-----
D.melanogaster   DG-------TTSTFQLDKEYEYME-----DVQPAEVQHND-----
H.sapiens        PDN-FDQEPILDSFNFSQEYLFQEQYLSKDLTPAVTDNDEADKKA

cons              .           *:  : * :       :: *    :.      


P.ultimum        ----------AYFALLQFDQPVLCPRDALVICSRLDLDPKKFACR
D.melanogaster   ----------VIYALLQFESPVLSPPHSTLIASKLDMDVHSTSCR
H.sapiens        GQATEGHCPRQQWALVEFEKPVTCPRLCLVIGSRLDADIHTNTCR

cons                         :**::*:.** .*  . :* *:** * :. :**


P.ultimum        LAFHGHVQTTSAGTDYVYASIDSLRIGKVKSREGNVDKVITTKDS
D.melanogaster   LAFWGRIAWQTHSSKYFQEELPKLRIFKRKQKVGSIQRVVNSSE-
H.sapiens        LAFHGILLHGLEDRNYADSFLPRLKVYKLKHKHGLVERAMDDYS-

cons             *** * :     . .*    :  *:: * * : * :::.:   . 


P.ultimum        SIRDVIAHSMFLKDVDW------TAGGVKGERGAIEKPFGKAGKV
D.melanogaster   ----VIVQNLFKD-AKRDLYVGKNVELSTGEKGRIERTFGQTSKV
H.sapiens        ----VIGRSLFKKETNIQLFVGLKVHLSTGELGIIDSAFGQSGKF

cons                 ** :.:* . ..       ..   .** * *: .**::.*.


P.ultimum        RVAFP----------------------------------------
D.melanogaster   AITFQDALSPETIS----------------------------NVK
H.sapiens        KIHIPGGLSPESKKILTPALKKRARAGRGEATRQEESAERSEPSQ

cons              : :                                         


P.ultimum        ----------------------E
D.melanogaster   NVKVLLNCKKYVFNKQAGL--FQ
H.sapiens        HVVLSLTFKRYVFDTHKRMVQSP

cons