T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=95
*
 BAD AVG GOOD
*
P.tricornutum    :  95
D.melanogaster   :  94
H.sapiens        :  95
cons             :  95

P.tricornutum    -----LNVNLGVLGHVDSGKTSLVKALSTLLSTAALDKSKQSRQR
D.melanogaster   M---PINFNIGLLGHVDSGKTTLAKALSSISSTAAFDKNPQSVER
H.sapiens        MAGRRVNVNVGVLGHIDSGKTALARALSTTASTAAFDKQPQSRER

cons                  :*.*:*:***:*****:*.:***:  ****:**. ** :*


P.tricornutum    GMTLDLGFSCFFLDMPSHLQASYPD------------KKNLQITL
D.melanogaster   GITLDLGFSGLLVDAPAHL----PQ------------GEQLQFTF
H.sapiens        GITLDLGFSCFSVPLPARLRSSLPEFQAAPEAEPEPGEPLLQVTL

cons             *:******* : :  *::*    *:               **.*:


P.tricornutum    VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDMVLLVVDAVKGWQAQTTECLVLAE
D.melanogaster   VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMLLVVDAQKGKQTQTAECLIIGE
H.sapiens        VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMMLVIDVTKGMQTQSAECLVIGQ

cons             *********************:::**:*. ** *:*::***::.:


P.tricornutum    LTSPYLVVALNKADQFPPPERDQLLEQAAAKIRDRLKATRFAN-A
D.melanogaster   LLQKKLIVVINKIDVYPENQRASKLEKLRLRLAKTLEATTFGGQV
H.sapiens        IACQKLVVVLNKIDLLPEGKRQAAIDKMTKKMQKTLENTKFRG-A

cons             :    *:*.:** *  *  :*   :::   :: . *: * * . .


P.tricornutum    PIVGVAACVGGEKLEVRNETYNMETLVQTLQDKLPPPKRTPEGSF
D.melanogaster   PICAVSALQGTH----------IAELREVLREAYFQPQRNLADPL
H.sapiens        PIIPVAAKPGGPEAPETEAPQGIPELIELLTSQISIPTRDPSGPF

cons             **  *:*  *            :  : * .    * *   ..:


P.tricornutum    YFSVDHCFSIRGRGTVLTGTVLNGAASVNDVLEFPTLGLDRKIKS
D.melanogaster   FMYVDHCFGIKGQGTVCTGTLLQGKVQVNNVIELPALGEQRKVKS
H.sapiens        LMSVDHCFSIKGQGTVMTGTILSGSISLGDSVEIPALKVVKKVKS

cons              : *****.*:*:*** ***:*.*  .:.: :*:*:*   :*:**


P.tricornutum    IQMFKRQVQRIQQGDRAGVCVSNLDAKLLERGIAATPGAVQLLKG
D.melanogaster   IQMFRKNVTSASMGDRIGLCVTQFNAKLLERGIITQPGYLKPIYA
H.sapiens        MQMFHMPITSAMQGDRLGICVTQFDPKLLERGLVCAPESLHTVHA

cons             :***:  :     *** *:**::::.******:   *  :: : .


P.tricornutum    AIALVRKVPYYVGTLHSGSKFHISVGHTTIMATVTFWGAVELLVD
D.melanogaster   VCLQFKPIRYYKEVIKSMRKMHISVGHNTVMANVTLFR------D
H.sapiens        ALISVEKIPYFRGPLQTKAKFHITVGHETVMGRLMFFSPAPDNFD

cons             .   .. : *:   :::  *:**:*** *:*. : ::       *


P.tricornutum    TKPSKRYVGSSSLGGDADMAGLPRMTFSFEEEFIHQDDLL-----
D.melanogaster   TDGT-------------------TSTFQLDKEYEYMEDVQ-----
H.sapiens        QEPI-------------------LDSFNFSQEYLFQEQYLSKDLT

cons              .                       :*.:.:*: . ::       


P.tricornutum    E--------------SLDGQESLLHWALLDFQIPVHCPMDSLVIG
D.melanogaster   ---------------PAEVQHNDVIYALLQFESPVLSPPHSTLIA
H.sapiens        PAVTDNDEADKKAGQATEGHCPRQQWALVEFEKPVTCPRLCLVIG

cons                            : :     :**::*: ** .*  . :*.


P.tricornutum    SRLDTVDNSTGSASACRLAFSGRLMQSVDPGK----DISKLRLYT
D.melanogaster   SKLDMDVHS----TSCRLAFWGRIAWQTHSSKYFQEELPKLRIFK
H.sapiens        SRLDADIHT----NTCRLAFHGILLHGLEDRNYADSFLPRLKVYK

cons             *:**   ::    .:***** * :     :     :.:*:::.


P.tricornutum    PKERRGTISRLGDPHKVFGSDLFKKETNMKAFFGMKVQTERNEIG
D.melanogaster   RKQKVGSIQRVVNSSEVIVQNLFKD-AKRDLYVGKNVELSTGEKG
H.sapiens        LKHKHGLVERAMDDYSVIGRSLFKKETNIQLFVGLKVHLSTGELG

cons              *.: * :.*  :  .*:  .***. :: . :.* :*. . .* *


P.tricornutum    EIKSSFGTSGKYRVFFPAGTEAKEE--------------------
D.melanogaster   RIERTFGQTSKVAITFQDALSPETISN------------------
H.sapiens        IIDSAFGQSGKFKIHIPGGLSPESKKILTPALKKRARAGRGEATR

cons              *. :** :.*  : :  . ..:                      


P.tricornutum    ----------------------------------K
D.melanogaster   ----------VKNVKVLLNCKKYVFNKQAG--LFQ
H.sapiens        QEESAERSEPSQHVVLSLTFKRYVFDTHKRMVQSP

cons