T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
 BAD AVG GOOD
*
T.trahens        :  94
D.melanogaster   :  95
H.sapiens        :  94
cons             :  94

T.trahens        -----LNVNVGLLGHVDSGKTSLAKALSTLASTAAFDKHPQSQVR
D.melanogaster   M---PINFNIGLLGHVDSGKTTLAKALSSISSTAAFDKNPQSVER
H.sapiens        MAGRRVNVNVGVLGHIDSGKTALARALSTTASTAAFDKQPQSRER

cons                  :*.*:*:***:*****:**:***: :*******:***  *


T.trahens        GITLDLGFSALRVPLPPALDK----------------YDEIQFTL
D.melanogaster   GITLDLGFSGLLVDAPAHLPQ----------------GEQLQFTF
H.sapiens        GITLDLGFSCFSVPLPARLRSSLPEFQAAPEAEPEPGEPLLQVTL

cons             ********* : *  *. * .                   :*.*:


T.trahens        VDCPGHASLIKTIIGGASIIDIMVLVVDAKAGFQTQTAECLVIGE
D.melanogaster   VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMLLVVDAQKGKQTQTAECLIIGE
H.sapiens        VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMMLVIDVTKGMQTQSAECLVIGQ

cons             **********:******.***:*:**:*.  * ***:****:**:


T.trahens        LTADTLMVALNKIDLFPEEKRASKVAKMTKRVAATLKPTAFAN-S
D.melanogaster   LLQKKLIVVINKIDVYPENQRASKLEKLRLRLAKTLEATTFGGQV
H.sapiens        IACQKLVVVLNKIDLLPEGKRQAAIDKMTKKMQKTLENTKFRG-A

cons             :  ..*:*.:****: ** :* : : *:  ::  **: * * .  


T.trahens        DILPVSASSG----------DGLSDLVDALTAAVRLPTRNEAEDA
D.melanogaster   PICAVSALQG----------THIAELREVLREAYFQPQRNLADP-
H.sapiens        PIIPVAAKPGGPEAPETEAPQGIPELIELLTSQISIPTRDPSGP-

cons              * .*:*  *            :.:* : *      * *: :   


T.trahens        FLFAIDHCFQVKGQGTVVTGTIQRGSVAVGQTIEFPALGLSKKVK
D.melanogaster   LFMYVDHCFGIKGQGTVCTGTLLQGKVQVNNVIELPALGEQRKVK
H.sapiens        FLMSVDHCFSIKGQGTVMTGTILSGSISLGDSVEIPALKVVKKVK

cons             ::: :**** :****** ***:  *.: :.: :*:***   :***


T.trahens        SMQMFKAPVERAVQGDRLGICVAQLNAKLLERGLACAPGTIRAVS
D.melanogaster   SIQMFRKNVTSASMGDRIGLCVTQFNAKLLERGIITQPGYLKPIY
H.sapiens        SMQMFHMPITSAMQGDRLGICVTQFDPKLLERGLVCAPESLHTVH

cons             *:***:  :  *  ***:*:**:*::.******:   *  ::.: 


T.trahens        AAVVRVSRIPYFRGEIKSRAKFHLTVGHETVMATLQFFRS-----
D.melanogaster   AVCLQFKPIRYYKEVIKSMRKMHISVGHNTVMANVTLFRD-----
H.sapiens        AALISVEKIPYFRGPLQTKAKFHITVGHETVMGRLMFFSPAPDNF

cons             *. : .. * *::  :::  *:*::***:***. : :*       


T.trahens        -V-GPAHVFSYDDEYLDVSELEG----PEAYPT------------
D.melanogaster   -TDGTTSTFQLDKEYEYMEDVQP----AEVQ-H------------
H.sapiens        DQEPILDSFNFSQEYLFQEQYLSKDLTPAVTDNDEADKKAGQATE

cons                     *. ..**   .:       . .               


T.trahens        ---GSTTYAVLELESPVLCAPDAMIIGSRLDSDVDGNVCRLAFSG
D.melanogaster   ---NDVIYALLQFESPVLSPPHSTLIASKLDMDVHSTSCRLAFWG
H.sapiens        GHCPRQQWALVEFEKPVTCPRLCLVIGSRLDADIHTNTCRLAFHG

cons                    :*::::*.** ..  . :*.*:** *:. . ***** *


T.trahens        SLVAPFD------SDTPWALKIFRVKAKVGHITRLKNEREAICKG
D.melanogaster   RIAWQTHSSKYFQEELP-KLRIFKRKQKVGSIQRVVNSSEVIVQN
H.sapiens        ILLHGLEDRNYADSFLP-RLKVYKLKHKHGLVERAMDDYSVIGRS

cons              :    .      .  *  *:::: * * * : *  :. ..* :.


T.trahens        LFPRAR---------------------------------------
D.melanogaster   LFKDAK-RDLYVGKNVELSTGEKGRIERTFGQTSKVAITFQDALS
H.sapiens        LFKKETNIQLFVGLKVHLSTGELGIIDSAFGQSGKFKIHIPGGLS

cons             **                                           


T.trahens        ---------------------------------------------
D.melanogaster   PETIS----------------------------NVKNVKVLLNCK
H.sapiens        PESKKILTPALKKRARAGRGEATRQEESAERSEPSQHVVLSLTFK

cons                                                          


T.trahens        ---------TRACT
D.melanogaster   KYVFNKQA--GLFQ
H.sapiens        RYVFDTHKRMVQSP

cons