T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=91
*
 BAD AVG GOOD
*
S.parasitica     :  90
D.melanogaster   :  92
H.sapiens        :  92
cons             :  91

S.parasitica     -----VNVNVGILGHVDSGKTSLVRSLSTHLSTAALDKNPQSKAR
D.melanogaster   M---PINFNIGLLGHVDSGKTTLAKALSSISSTAAFDKNPQSVER
H.sapiens        MAGRRVNVNVGVLGHIDSGKTALARALSTTASTAAFDKQPQSRER

cons                  :*.*:*:***:*****:*.::**:  ****:**:***  *


S.parasitica     GITLDLGFSSLQLPFTAASG----------------EAYTAQLTL
D.melanogaster   GITLDLGFSGLLVDAPAHLP----------------QGEQLQFTF
H.sapiens        GITLDLGFSCFSVPLPARLRSSLPEFQAAPEAEPEPGEPLLQVTL

cons             ********* : :  .*                        *.*:


S.parasitica     VDCPGHASLIKTVIGGAHIIDMALLVIDAVKGIQMQTIESTVLAE
D.melanogaster   VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMLLVVDAQKGKQTQTAECLIIGE
H.sapiens        VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMMLVIDVTKGMQTQSAECLVIGQ

cons             **********:*:****:***: :**:*. ** * *: *. ::.:


S.parasitica     IATSHVIVVLNKVDLLTDK--ATQLPAMLATIRTFLSSSPTLQD-
D.melanogaster   LLQKKLIVVINKIDVYPENQRASKLEKLRLRLAKTLEATT-FGGQ
H.sapiens        IACQKLVVVLNKIDLLPEGKRQAAIDKMTKKMQKTLENTK-FRG-

cons             :  .:::**:**:*: .:    : :  :   : . *. :  : . 


S.parasitica     CPIVPVAAGDA----DGARAPQGMPDLLATMQRHLHLPTRSGDGP
D.melanogaster   VPICAVSALQG----------THIAELREVLREAYFQPQRNLADP
H.sapiens        APIIPVAAKPGGPEAPETEAPQGIPELIELLTSQISIPTRDPSGP

cons              ** .*:*  .            :.:*   :      * *.  .*


S.parasitica     LCYAIDHCFPLRGKGTVLTGTVLSGTVRVNDTIAIPILGTEKKVK
D.melanogaster   LFMYVDHCFGIKGQGTVCTGTLLQGKVQVNNVIELPALGEQRKVK
H.sapiens        FLMSVDHCFSIKGQGTVMTGTILSGSISLGDSVEIPALKVVKKVK

cons             :   :**** ::*:*** ***:*.*.: :.: : :* *   :***


S.parasitica     SLQMFHTSVEKAIQGDRVGLRLHGLDAATLERGLAITPKSLSFVL
D.melanogaster   SIQMFRKNVTSASMGDRIGLCVTQFNAKLLERGIITQPGYLKPIY
H.sapiens        SMQMFHMPITSAMQGDRLGICVTQFDPKLLERGLVCAPESLHTVH

cons             *:***:  : .*  ***:*: :  ::.  ****:   *  *  : 


S.parasitica     NLVLQVHRVRFFGLDCESGAKVHVTVGHSTVLAKATFFHGSH---
D.melanogaster   AVCLQFKPIRYYKEVIKSMRKMHISVGHNTVMANVTLFRDTD---
H.sapiens        AALISVEKIPYFRGPLQTKAKFHITVGHETVMGRLMFFSPAPDNF

cons                :... : ::    ::  *.*::***.**:..  :*  :    


S.parasitica     ------ASFAVENTEYRYLA-----TLPASATD------------
D.melanogaster   ---GTTSTFQL-DKEYEYME-----DVQPAEVQH-----------
H.sapiens        DQEPILDSFNF-SQEYLFQEQYLSKDLTPAVTDNDEADKKAGQAT

cons                    :* . . ** :        : .: .:            


S.parasitica     ------HLFVLLQLEREILVPPFSHVICSRLDTTVSQSNVCRIAF
D.melanogaster   ----NDVIYALLQFESPVLSPPHSTLIASKLDMDV-HSTSCRLAF
H.sapiens        EGHCPRQQWALVEFEKPVTCPRLCLVIGSRLDADI-HTNTCRLAF

cons                     :.*:::*  :  *  . :* *:**  : ::. **:**


S.parasitica     YGPVVATLDN-----------------------------------
D.melanogaster   WGRIAWQTHSSKYFQEELPKLRIFKRKQKVGSIQRVVNSSEVIVQ
H.sapiens        HGILLHGLEDRNYADSFLPRLKVYKLKHKHGLVERAMDDYSVIGR

cons              * :    ..                                   


S.parasitica     ---------------------------------------------
D.melanogaster   NLFKD-AKRDLYVGKNVELSTGEKGRIERTFGQTSKVAITFQDAL
H.sapiens        SLFKKETNIQLFVGLKVHLSTGELGIIDSAFGQSGKFKIHIPGGL

cons                                                          


S.parasitica     ---------------------------------------------
D.melanogaster   SPETIS----------------------------NVKNVKVLLNC
H.sapiens        SPESKKILTPALKKRARAGRGEATRQEESAERSEPSQHVVLSLTF

cons                                                          


S.parasitica     -----------VLLC
D.melanogaster   KKYVFNKQA--GLFQ
H.sapiens        KRYVFDTHKRMVQSP

cons