T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=90
*
 BAD AVG GOOD
*
C.muris          :  87
D.melanogaster   :  91
H.sapiens        :  90
cons             :  90

C.muris          ---------------------------------------------
D.melanogaster   M---PINFNIGLLGHVDSGKTTLAKALSSISSTAAFDKNPQSVER
H.sapiens        MAGRRVNVNVGVLGHIDSGKTALARALSTTASTAAFDKQPQSRER

cons                                                          


C.muris          GITIDIALWKFET-------------------------PRYEYTV
D.melanogaster   GITLDLGFSGLLVDAPAHL----------------PQGEQLQFTF
H.sapiens        GITLDLGFSCFSVPLPARLRSSLPEFQAAPEAEPEPGEPLLQVTL

cons             ***:*:.:  : .                            : *.


C.muris          IDAPGHRDFIKNMITGTSQADVALLVVPADRFEGAFSKEGQTREH
D.melanogaster   VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMLLVVDAQK-----GKQTQTAEC
H.sapiens        VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMMLVIDVTK-----GMQTQSAEC

cons             :*.*** .:*:.:* *:.  *: :**: . :     . : *: * 


C.muris          ALLAFTLGVKQMIVGINKMDTCD--YKQSRYDEIHNEVEGYLKKV
D.melanogaster   -LIIGELLQKKLIVVINKIDVYPENQRASKLEKLRLRLAKTLEAT
H.sapiens        -LVIGQIACQKLVVVLNKIDLLPEGKRQAAIDKMTKKMQKTLENT

cons              *:   :  ::::* :**:*      : :  :::  .:   *: .


C.muris          GYNIEKIPFVAISGFVGD----------NMVEKSDKMPWYKEPPK
D.melanogaster   TFGGQ-VPICAVSALQGT----------HIAELREVLREAYFQPQ
H.sapiens        KFRGA--PIIPVAAKPGGPEAPETEAPQGIPELIELLTSQISIPT

cons              :     *: .::.  *            : *  : :      * 


C.muris          RPTEKPLRLPLQDVYKIGGVGTVPVGRVETGIIKPGMNVTFAPVG
D.melanogaster   RNLADPLFMYVDHCFGIKGQGTVCTGTLLQGKVQVNNVIELPALG
H.sapiens        RDPSGPFLMSVDHCFSIKGQGTVMTGTILSGSISLGDSVEIPALK

cons             *    *: : ::. : * * *** .* :  * :. .  : :..: 


C.muris          ITTEVKSVEMHHEQLSEAGPGDNVGFNVKNVSIKDIKRGYVASDG
D.melanogaster   EQRKVKSIQMFRKNVTSASMGDRIGLCVTQFNAKLLERGIITQPG
H.sapiens        VVKKVKSMQMFHMPITSAMQGDRLGICVTQFDPKLLERGLVCAPE

cons                :***::*.:  ::.*  **.:*: *.:.. * ::** :    


C.muris          YLSPIFKVPAKIRP-------------------------------
D.melanogaster   YLKPIYAVCLQFKPIRYYKEVIKSMRKMHISVGHNTVMANVTLFR
H.sapiens        SLHTVHAALISVEKIPYFRGPLQTKAKFHITVGHETVMGRLMFFS

cons              * .:. .  ...                                


C.muris          ---------------------------------------------
D.melanogaster   ------DTDGTTSTFQLDKEYEYME-----DVQPAEVQHND----
H.sapiens        PAPDNFDQEPILDSFNFSQEYLFQEQYLSKDLTPAVTDNDEADKK

cons                                                          


C.muris          ---------------------------------------------
D.melanogaster   -----------VIYALLQFESPVLSPPHSTLIASKLDMDVHSTSC
H.sapiens        AGQATEGHCPRQQWALVEFEKPVTCPRLCLVIGSRLDADIHTNTC

cons                                                          


C.muris          ---------------------------------------------
D.melanogaster   RLAFWGRIAWQTHSSKYFQEELPKLRIFKRKQKVGSIQRVVNSSE
H.sapiens        RLAFHGILLHGLEDRNYADSFLPRLKVYKLKHKHGLVERAMDDYS

cons                                                          


C.muris          ---------------------------------------------
D.melanogaster   VIVQNLFKD-AKRDLYVGKNVELSTGEKGRIERTFGQTSKVAITF
H.sapiens        VIGRSLFKKETNIQLFVGLKVHLSTGELGIIDSAFGQSGKFKIHI

cons                                                          


C.muris          ---------------------------------------------
D.melanogaster   QDALSPETIS----------------------------NVKNVKV
H.sapiens        PGGLSPESKKILTPALKKRARAGRGEATRQEESAERSEPSQHVVL

cons                                                          


C.muris          -----------------LS
D.melanogaster   LLNCKKYVFNKQAGL--FQ
H.sapiens        SLTFKRYVFDTHKRMVQSP

cons