T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=90
*
 BAD AVG GOOD
*
H.arabidopsidis   :  89
D.melanogaster    :  91
H.sapiens         :  91
cons              :  90

H.arabidopsidis   -----VNVNVGVLGHVDSGKTSLVRALSTHLSTAALDKSPQSQRR
D.melanogaster    M---PINFNIGLLGHVDSGKTTLAKALSSISSTAAFDKNPQSVER
H.sapiens         MAGRRVNVNVGVLGHIDSGKTALARALSTTASTAAFDKQPQSRER

cons                   :*.*:*:***:*****:*.:***:  ****:**.*** .*


H.arabidopsidis   GITLDLGFSSFRLDIRKGG------------------PSFLQVTL
D.melanogaster    GITLDLGFSGLLVDAPAHL----------------PQGEQLQFTF
H.sapiens         GITLDLGFSCFSVPLPARLRSSLPEFQAAPEAEPEPGEPLLQVTL

cons              ********* : :                           **.*:


H.arabidopsidis   VDCPGHTSLFQTVLGGAAIIDTVVLVTDCRKGLEAQTIESLLLAS
D.melanogaster    VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMLLVVDAQKGKQTQTAECLIIGE
H.sapiens         VDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMMLVIDVTKGMQTQSAECLVIGQ

cons              ******:**::*::*** *** ::** *  ** ::*: *.*::..


H.arabidopsidis   LVCPRKLVIVLTKTDLLSALDVERAAAIGAVTSEVQ-TFVATHFS
D.melanogaster    LLQ-KKLIVVINKIDVYP--ENQRASKLEKLRLRLAKTLEATTFG
H.sapiens         IAC-QKLVVVLNKIDLLP--EGKRQAAIDKMTKKMQKTLENTKFR

cons              :   :**::*:.* *: .  : :* : :  :  .:  *:  * * 


H.arabidopsidis   SLKDVTIPVVPVVVGTG-------HKTEGIPHLLEVLRTHLQAPE
D.melanogaster    GQ----VPICAVSALQG----------THIAELREVLREAYFQPQ
H.sapiens         G-----APIIPVAAKPGGPEAPETEAPQGIPELIELLTSQISIPT

cons              .      *: .* .  *            *..* *:*      * 


H.arabidopsidis   RDTSGDFRLAVDHCFAVPGHGTVLTGTVLSGALSKGSELELLPSG
D.melanogaster    RNLADPLFMYVDHCFGIKGQGTVCTGTLLQGKVQVNNVIELPALG
H.sapiens         RDPSGPFLMSVDHCFSIKGQGTVMTGTILSGSISLGDSVEIPALK

cons              *: :. : : *****.: *:*** ***:*.* :. .. :*: .  


H.arabidopsidis   MKTTVKTLQVFRQDVERCVQGDRVGLRVNGLDPALVERALAVSPP
D.melanogaster    EQRKVKSIQMFRKNVTSASMGDRIGLCVTQFNAKLLERGII-TQP
H.sapiens         VVKKVKSMQMFHMPITSAMQGDRLGICVTQFDPKLLERGLV-CAP

cons                 .**::*:*:  :  .  ***:*: *. ::. *:**.:    *


H.arabidopsidis   GSLPAVTQVVIAVARVPLFQGGACKSGAKCHATVGHATVIATATF
D.melanogaster    GYLKPIYAVCLQFKPIRYYKE-VIKSMRKMHISVGHNTVMANVTL
H.sapiens         ESLHTVHAALISVEKIPYFRG-PLQTKAKFHITVGHETVMGRLMF

cons                * .:  . : .  :  ::    ::  * * :*** **:.   :


H.arabidopsidis   FARLGRTEGDAGNILEDMFDPLALYEYVP-----DLDFGYSVQDG
D.melanogaster    FRD-------TDGTTS-TFQLDKEYEYME-----DVQPAE-VQH-
H.sapiens         FSPAPDN-FDQEPILD-SFNFSQEYLFQEQYLSKDLTPA--VTDN

cons              *              .  *:    * :       *:  .  * . 


H.arabidopsidis   KN----------STEATTIFALLQFERAVFCPPATLVVCSRLDLD
D.melanogaster    N---------------DVIYALLQFESPVLSPPHSTLIASKLDMD
H.sapiens         DEADKKAGQATEGHCPRQQWALVEFEKPVTCPRLCLVIGSRLDAD

cons              .                  :**::** .* .*    :: *:** *


H.arabidopsidis   AKRFSCRLAFYGT--------------------------------
D.melanogaster    VHSTSCRLAFWGRIAWQTHSSKYFQEELPKLRIFKRKQKVGSIQR
H.sapiens         IHTNTCRLAFHGILLHGLEDRNYADSFLPRLKVYKLKHKHGLVER

cons               :  :***** *                                 


H.arabidopsidis   ---------------------------------------------
D.melanogaster    VVNSSEVIVQNLFKD-AKRDLYVGKNVELSTGEKGRIERTFGQTS
H.sapiens         AMDDYSVIGRSLFKKETNIQLFVGLKVHLSTGELGIIDSAFGQSG

cons                                                           


H.arabidopsidis   ---------------------------------------------
D.melanogaster    KVAITFQDALSPETIS----------------------------N
H.sapiens         KFKIHIPGGLSPESKKILTPALKKRARAGRGEATRQEESAERSEP

cons                                                           


H.arabidopsidis   ------------------------V
D.melanogaster    VKNVKVLLNCKKYVFNKQAGLF--Q
H.sapiens         SQHVVLSLTFKRYVFDTHKRMVQSP

cons