T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
 BAD AVG GOOD
*
S.parasitica     :  95
D.melanogaster   :  93
M.musculus       :  94
cons             :  94

S.parasitica     ----------------------------------------FNPTD
D.melanogaster   ---------------------------------------MFQPEK
M.musculus       MAEAAAAGASGETMAALVAAEGSLGPAGWSAGRSFSNYRPFEPQT

cons                                                     *:*  


S.parasitica     HGLREDFRLTDFSALKGXGCKLPQEKLLSYISGIAND-LKPN---
D.melanogaster   HGLEPDFQLTKFTTHTGXSCKIPQKVLEKYLRGTEIE-NKNN---
M.musculus       LGFSPSWRLTSFSGMKGXGCKVPQETLLKLLEGLTRPALQPPLTS

cons              *:  .::**.*:  .**.**:**: * . : *      :     


S.parasitica     --------------------EV----SATPGMDSSVVKIKHPKFG
D.melanogaster   --------------------DGY---LIGSGMDCAVIPLKRH--K
M.musculus       GLVGGQEETVQEGGLSTRPGPGSAFPSLSIGMDSCVIPLRH---G

cons                                           ***..*: :::    


S.parasitica     DLYMISTTDFFYPLVQDPYVQGRIACANVLSDLYAMGVTEVDTML
D.melanogaster   DYLLIQTVDFFYPMVNDPELLGRIALANVLSDVYAVGVTQFDTVE
M.musculus       GLSLVQTTDFFYPLVEDPYMMGRIACANVLSDLYAMGITECDNML

cons             .  ::.*.*****:*:** : **** ******:**:*:*: *.: 


S.parasitica     MILGVSRTMTDLERDVVTTQLIHGFNDLAREAGT---NVTGGQTV
D.melanogaster   MIVSTSTSFSEKERDVVIGLVMKGFQNSLKANGYRNTPLIIRQLK
M.musculus       MLLSVSQSMSEKEREKVTPLMIKGFRDAAEEGGT---AVTGGQTV

cons             *::..* :::: **: *   :::**.:  .  *     :   *  


S.parasitica     MNPWPIVGGVAMSVRAESEIIRPENATAGQMLVLTKPLGTQLAVN
D.melanogaster   INPWCIIGGIATSVCRSEEIILPSNAQPGDVLVLTKPLGGQMAMD
M.musculus       VNPWIIIGGVATVVCQQNEFIMPDSAVVGDVLVLTKPLGTQVAAN

cons             :*** *:**:*  *  ..*:* *..*  *::******** *:* :


S.parasitica     AYQM-KDQPARWSKVESFLTREMADRAFSVASESMSRLNVNGAKL
D.melanogaster   AHLWQLNQTEKYKKLLSECSDADIKETFEIAVKSMTYLNKNAALL
M.musculus       AHQW-LDNPEKWNKIKMVVSREEVELAYQEAMFNMATLNRTAAGL

cons             *:    ::. ::.*:    :    . ::. *  .*: ** ..* *


S.parasitica     MHKHGVTSATDVTGFGILGHAQNMATSQKADVDFELHTLPVIKDM
D.melanogaster   MHKYQAHCATDITGFGLLGHANNLAQFQKEKVLFQINKLPIIKNV
M.musculus       MHTFNAHAATDITGFGILGHSQNLAKQQKNEVSFVIHNLPIIAKM

cons             **.. . .***:****:***::*:*  ** .* * ::.**:* .:


S.parasitica     LAVNEAFNGQWRLELGFSSETSGGLLVSIDADR------------
D.melanogaster   LKFSTLVGQSTKFRSGRSVETSGGLLICLPADAADKFCRDFEEAT
M.musculus       AAISKA-SGRFGLLQGTSAETSGGLLICLPREQAARFCSEIKSSK

cons               ..   .    :  * * *******:.:  :             


S.parasitica     ---------------------------------------------
D.melanogaster   NGEQ-KSFQIGHVTAANESDAVLCEDVEFIEV-------------
M.musculus       YGEGHQAWIVGIVEKGNRTAR-IIDKPRVIEVLPRGASAAAAAAP

cons                                                          


S.parasitica     ----------A
D.melanogaster   ---------SL
M.musculus       DNSNAASEPSS

cons