T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
 BAD AVG GOOD
*
C.owczarzaki     :  95
D.melanogaster   :  93
M.musculus       :  94
cons             :  94

C.owczarzaki     ----------------------------------------FNPET
D.melanogaster   ---------------------------------------MFQPEK
M.musculus       MAEAAAAGASGETMAALVAAEGSLGPAGWSAGRSFSNYRPFEPQT

cons                                                     *:*:.


C.owczarzaki     LGLPADWRLTKFTQLKGCGCKVPQKDLLKLLEVFRANS--NNAVD
D.melanogaster   HGLEPDFQLTKFTTHTGUSCKIPQKVLEKYLRGTEIEN--KNN-D
M.musculus       LGFSPSWRLTSFSGMKGUGCKVPQETLLKLLEGLTRPALQPPLTS

cons              *: ..::**.*:  .* .**:**: * * *.            .


C.owczarzaki     G-------------------------TIGVGLDSCVTET-RHPGL
D.melanogaster   G------------------------YLIGSGMDCAVIPLKRHKDY
M.musculus       GLVGGQEETVQEGGLSTRPGPGSAFPSLSIGMDSCVIPL-RHGGL

cons             *                          :. *:*..*    ** . 


C.owczarzaki     YLVQTTDFFFPLIEDPYQMGRIACANVLSDLYAMGVSECDNMLML
D.melanogaster   LLIQTVDFFYPMVNDPELLGRIALANVLSDVYAVGVTQFDTVEMI
M.musculus       SLVQTTDFFYPLVEDPYMMGRIACANVLSDLYAMGITECDNMLML

cons              *:**.***:*:::**  :**** ******:**:*::: *.: *:


C.owczarzaki     LGVSTTLTPEESVIVTPLVMKGFHDLCQEAG---TNVLGGQTVKN
D.melanogaster   VSTSTSFSEKERDVVIGLVMKGFQNSLKANGYRNTPLIIRQLKIN
M.musculus       LSVSQSMSEKEREKVTPLMIKGFRDAAEEGG---TAVTGGQTVVN

cons             :..* ::: :*   *  *::***::  :  *     *   *


C.owczarzaki     PWFLLGGVATSVVGRHEMIMPDGAKSGDVLVLTKPLGNQLAVNAH
D.melanogaster   PWCIIGGIATSVCRSEEIILPSNAQPGDVLVLTKPLGGQMAMDAH
M.musculus       PWIIIGGVATVVCQQNEFIMPDSAVVGDVLVLTKPLGTQVAANAH

cons             ** ::**:** *   .*:*:*..*  *********** *:* :**


C.owczarzaki     QWMLTDPERYKRLDGVLTNEQVIEAYEHAITNMTRLSRVAARLMR
D.melanogaster   LWQLNQTEKYKKLLSECSDADIKETFEIAVKSMTYLNKNAALLMH
M.musculus       QW-LDNPEKWNKIKMVVSREEVELAYQEAMFNMATLNRTAAGLMH

cons              * * :.*:::::    :  ::  ::: *: .*: *.: ** **:


C.owczarzaki     EFGAHAATDVTGFGILGHARNLARSQKDSVNFEIDVFPVLRHMIA
D.melanogaster   KYQAHCATDITGFGLLGHANNLAQFQKEKVLFQINKLPIIKNVLK
M.musculus       TFNAHAATDITGFGILGHSQNLAKQQKNEVSFVIHNLPIIAKMAA

cons              : **.***:****:***:.***: **:.* * *. :*:: ::  


C.owczarzaki     MERATPVF-HLLEGTSAETSGGLLIA-------------------
D.melanogaster   FSTLVGQSTKFRSGRSVETSGGLLICLPADAADKFCRDFEEATNG
M.musculus       ISKASGRF-GLLQGTSAETSGGLLICLPREQAARFCSEIKSSKYG

cons             :       .* *.********.                   


C.owczarzaki     ---------------------------------------------
D.melanogaster   EQ-KSFQIGHVTAANESDAVLCEDVEFIEV---------------
M.musculus       EGHQAWIVGIVEKGNRTAR-IIDKPRVIEVLPRGASAAAAAAPDN

cons                                                          


C.owczarzaki     --------L
D.melanogaster   -------SL
M.musculus       SNAASEPSS

cons