T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=93
*
 BAD AVG GOOD
*
B.hominis        :  93
D.melanogaster   :  92
M.musculus       :  93
cons             :  93

B.hominis        ---------------------------------------------
D.melanogaster   ---------------------------------------MFQPEK
M.musculus       MAEAAAAGASGETMAALVAAEGSLGPAGWSAGRSFSNYRPFEPQT

cons                                                          


B.hominis        ----------------GXGCKVPQAKLLEYLKGVGTSI-KEN---
D.melanogaster   HGLEPDFQLTKFTTHTGXSCKIPQKVLEKYLRGTEIEN-KNN--D
M.musculus       LGFSPSWRLTSFSGMKGXGCKVPQETLLKLLEGLTRPALQPPLTS

cons                             **.**:**  * : *.*      :     


B.hominis        ---------------------------ETPGLDCAVVKTK-----
D.melanogaster   G------------------------YLIGSGMDCAVIPLKRHKDY
M.musculus       GLVGGQEETVQEGGLSTRPGPGSAFPSLSIGMDSCVIPLR-HGGL

cons                                           *:*..*:  :     


B.hominis        --ISTTDFFYPSVDDPYVQGKIAACNVLSDMYAMGVTEVDTMLMI
D.melanogaster   LLIQTVDFFYPMVNDPELLGRIALANVLSDVYAVGVTQFDTVEMI
M.musculus       SLVQTTDFFYPLVEDPYMMGRIACANVLSDLYAMGITECDNMLML

cons               :.*.***** *:** : *:** .*****:**:*:*: *.: *:


B.hominis        LGVSVDMEPDAMDYVTKELIRGFNDQARVAV---TNVTGGQTVRN
D.melanogaster   VSTSTSFSEKERDVVIGLVMKGFQNSLKANGYRNTPLIIRQLKIN
M.musculus       LSVSQSMSEKEREKVTPLMIKGFRDAAEEGG---TAVTGGQTVVN

cons             :..* .:. .  : *   :::**.:  .      * :   *   *


B.hominis        PWPMIGGVASSTCREGEDFIRPVHGEPGDVIVLTKPLGTQLAVNM
D.melanogaster   PWCIIGGIATSVCRS-EEIILPSNAQPGDVLVLTKPLGGQMAMDA
M.musculus       PWIIIGGVATVVCQQ-NEFIMPDSAVVGDVLVLTKPLGTQVAANA

cons             ** :***:*: .*:. :::* *  .  ***:******* *:* : 


B.hominis        FEW-LRTAAKFNRVRAVLSVEDVVASYKMAMESMSTLNLEGARLM
D.melanogaster   HLWQLNQTEKYKKLLSECSDADIKETFEIAVKSMTYLNKNAALLM
M.musculus       HQW-LDNPEKWNKIKMVVSREEVELAYQEAMFNMATLNRTAAGLM

cons             . * *  . *::::    *  ::  ::: *: .*: **  .* **


B.hominis        WKHHAHGCTDVTGFGVTGHATNLAAEQEKAVDLVVDTLPIIKNMA
D.melanogaster   HKYQAHCATDITGFGLLGHANNLAQFQKEKVLFQINKLPIIKNVL
M.musculus       HTFNAHAATDITGFGILGHSQNLAKQQKNEVSFVIHNLPIIAKMA

cons              ..:** .**:****: **: ***  *:: * : :..**** :: 


B.hominis        RVESHLNNNWNLFKGRSAETSGGLMIMMRPEDAEAYIKEYKEIT-
D.melanogaster   KFSTLVGQSTKFRSGRSVETSGGLLICLPADAADKFCRDFEEATN
M.musculus       AISKASGR-FGLLQGTSAETSGGLLICLPREQAARFCSEIKSSKY

cons              ...  ..   : .* *.******:* :  : *  :  : :. . 


B.hominis        --GHDAWIIGKVVEGQRKG-YVVENPTLIE---------------
D.melanogaster   GE-QKSFQIGHVTAANESDAVLCEDVEFIEV--------------
M.musculus       GEGHQAWIVGIVEKGNRTA-RIIDKPRVIEVLPRGASAAAAAAPD

cons                :.:: :* *  .:..   : :.  .**               


B.hominis        ---------V
D.melanogaster   --------SL
M.musculus       NSNAASEPSS

cons