T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame
CPU TIME:0 sec.
SCORE=80
*
BAD AVG GOOD
*
P.ultimum : 78
A.aegypti : 78
D.rerio : 81
H.sapiens : 86
M.musculus : 86
S.mansoni : 74
cons : 80
P.ultimum ------TLWMGDIQMHWDEAFISSLFAATGEQPV-VKLIRDKVTGYPA
A.aegypti MSSIQCQLWMGSLESYMTENFILAAFRKMGEDPQTVKLMRNKYTGDPA
D.rerio MFNRMTSLWMGDLDPYMDENFIKQAFSTMGETAFGVKIITHRVTGGSA
H.sapiens M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
M.musculus M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
S.mansoni MQNFSHTIWMGDLEPYMDEMFIKRAFETSGENIVSVKVIRNKATGQTL
cons :***.:: : * ** * ** **:: .: ** .
P.ultimum GYGFLEFPTQRGAQLVLETYNGQVIPNT--LHRFRMNWGAGGRR--IE
A.aegypti GYCFVSFKTDEAAIDAMHKLNGKPIPGTNPLVRFRLNSATNNQNKALL
D.rerio GYCFVEMADEASVDRCVQRLNGKLVPGSNPPRKFKLNYATYGKR--PE
H.sapiens GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQ--PD
M.musculus GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQ--PD
S.mansoni GYGFIEFANSTSARDAMLKLNGKLIPGA-PTRRFKLNHASYGKD--ST
cons ** *:.: . : **: :*.: :*::* .: .:
P.ultimum TGDDHSVFVGDLAPDVSDELLLTTFSTRFSSVRGAKVVIDPVTRMSKG
A.aegypti ADREFSVWVGDLSSDVDDYSLYRVFSAKYTSIKTAKVILDS-SGFSKG
D.rerio PGPEFSVFVGDLTSEVDDYQLHQFFLKKFPSCKGAKVVTDP-YGNSRG
H.sapiens NSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQ-TGVSKG
M.musculus NSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDP-TGVSKG
S.mansoni SSNECSLFVGELTEDVDDLALFNAF-KKYPTCRSAKVVMT--NGKSRG
cons . : *::**:*: :*.* * * :.: : .**: *:*
P.ultimum FGFVRFGNKEEADQALQTMNG-VYCSSRPMRVSVATDRNGKPRS----
A.aegypti YGFVKFGLEDEQKSALYEMNGFIGLGCKPLKICNAVPKPKNELGPAGP
D.rerio YGFVKFSDENEQKKALEEFQNASGLGGKPIRISIAVNKGNKAST----
H.sapiens YGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRVKP----
M.musculus YGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGCKPVRLSVAIPKASRVKP----
S.mansoni YGFVRFLTESDMDKALIEMQNYCGLGYKPIRVSLAIPKRYNADGSLVV
cons :***:* : : . ** :. . :*:::. * : .
P.ultimum -----------------------G-----G-YYQ-QYP-NYQQSG---
A.aegypti TSST--P---------------SAASLL-G-YGT---ATDYS-QYYDP
D.rerio -----------------------Y-----HNQNN-TYNTNYQQQYYQ-
H.sapiens -----------------------V-----E-YSQ-MYSYSYN-QYYQ-
M.musculus -----------------------V-----E-YSQ-MYSYSYN-QYYQ-
S.mansoni TTTASETSSVVPSGMPDPFTAAVAAAVTGNSAAQAEYYQAYQ-QYYQ-
cons *. .
P.ultimum ---YQNYYGYGGYYPQYQQVGGYG-GYGGYGSYD--------------
A.aegypti STYWQNYSAWQGYYD---ATGTADYSAYQMPA---A------------
D.rerio -QPYNSYYPQWGYD---QYSG-YNYGYNPYA-APPPMMGPPPPM---G
H.sapiens -Q-YQNYYAQWGYD---QNTGSYSYSYPQYG-YT--------------
M.musculus -Q-YQNYYAQWGYD---QNTGSYSYSYPQYG-YT--------------
S.mansoni -QYYASQYAAQFYS---SESSTNGDSA-NSG-I-TSIAGGGTLVGDAT
cons : . * . . .
P.ultimum -----------------QQ---GSQQHDEIGEDP--LQSQMAMAKDTE
A.aegypti ----AAVDASAYHAYE-QQ-QQHHHAHSQVEDEELTLVDHKYTLDVEK
D.rerio MPPMP---------PDMQGSTEAHDGTEEVEEDP--SEDPNPQVDVEE
H.sapiens -----------------QS---TMQTYEEVGDDA--LEDPMPQLDVTE
M.musculus -----------------QS---TMQTYEEVGDDA--LEDPAPQLDVTE
S.mansoni VQQHAFVDAAASHLYA-RALQQGT-GSQEY--------APEPHVLSSA
cons : .:
P.ultimum DEE-AFKARIKEQYQV----------------------L
A.aegypti LNR-EVMERDRNLYDALESSKWMPVEQ-LE-------IF
D.rerio LNR-QYMERSEELYDSLMECHWLPMDT-ITSDISMMNGS
H.sapiens ANK-EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
M.musculus ANK-EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
S.mansoni CDRPRHVDDLDEVFNFLESSRWHVTDPSLGLFIKI--RP
cons :. : ::