T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=83
*
 BAD AVG GOOD
*
P.tricornutum   :  85
A.aegypti       :  80
D.rerio         :  83
H.sapiens       :  87
M.musculus      :  87
S.mansoni       :  76
cons            :  83

P.tricornutum   ------SLYVGDLAPDVNESLLFEIFSAVGP-VASIRVCRDAVTR
A.aegypti       MSSIQCQLWMGSLESYMTENFILAAFRKMGEDPQTVKLMRNKYTG
D.rerio         MFNRMTSLWMGDLDPYMDENFIKQAFSTMGETAFGVKIITHRVTG
H.sapiens       M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTG
M.musculus      M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTG
S.mansoni       MQNFSHTIWMGDLEPYMDEMFIKRAFETSGENIVSVKVIRNKATG

cons                   :::*.* . : * ::   *   *     :::  .  * 


P.tricornutum   RSLGYSYVNFHQMADAERAMDTMNFSMIKGKPCRIMWKTSYPAKL
A.aegypti       DPAGYCFVSFKTDEAAIDAMHKLNGKPIPGTNPLVRFRLNSATNN
D.rerio         GSAGYCFVEMADEASVDRCVQRLNGKLVPGSNPPRKFKLNYATYG
H.sapiens       IPAGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYG
M.musculus      IPAGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYG
S.mansoni       QTLGYGFIEFANSTSARDAMLKLNGKLIPGAP-TRRFKLNHASYG

cons             . ** ::.:     .  .:  :* . : *      :: . .:  


P.tricornutum   S--QIVRFQGVNLYVKNLDDSVTDDMLRDEFA-VMGTITSARVMK
A.aegypti       QNKALLADREFSVWVGDLSSDVDDYSLYRVFSAKYTSIKTAKVIL
D.rerio         K--RPEPGPEFSVFVGDLTSEVDDYQLHQFFLKKFPSCKGAKVVT
H.sapiens       K--QPDNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVL
M.musculus      K--QPDNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVL
S.mansoni       K--DSTSSNECSLFVGELTEDVDDLALFNAFK-KYPTCRSAKVVM

cons            .          .::* :*  .* *  *   *     :   .:*: 


P.tricornutum   DAKDGRSRGFGFVCYSTPEESTRAVNEMNGKL-IANKPIFVALAQ
A.aegypti       DS-SGFSKGYGFVKFGLEDEQKSALYEMNGFIGLGCKPLKICNAV
D.rerio         DP-YGNSRGYGFVKFSDENEQKKALEEFQNASGLGGKPIRISIAV
H.sapiens       DQ-TGVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAI
M.musculus      DP-TGVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGCKPVRLSVAI
S.mansoni       -T-NGKSRGYGFVRFLTESDMDKALIEMQNYCGLGYKPIRVSLAI

cons                * *:*:*** :    :   *: * :.   :. **: :. * 


P.tricornutum   RRATAIR-P--------------------------------LT-T
A.aegypti       PKPKNELGPAGPTSSTP--S---------------AASLL--G-Y
D.rerio         NKGNKAS-T--------------------------------YHNQ
H.sapiens       PKASRVK-P--------------------------------VE-Y
M.musculus      PKASRVK-P--------------------------------VE-Y
S.mansoni       PKRYNADGSLVVTTTASETSSVVPSGMPDPFTAAVAAAVTGNS-A

cons             :      .                                    


P.tricornutum   SDVEVY-SFE-SFVED--F-S------------------------
A.aegypti       GTA---TDYS-QYYDPSTYWQNYSAWQGYYDATGTADYSAYQM--
D.rerio         NNTYN-TNYQQQYYQQ--PYNSYYPQWGYDQYSG-YNYGYNPYAA
H.sapiens       SQMYS-YSYN-QYYQQ---YQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQYGY
M.musculus      SQMYS-YSYN-QYYQQ---YQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQYGY
S.mansoni       AQAEYYQAYQ-QYYQQ--YYASQYAAQFYSSESSTNGDSA-NSGI

cons                    :. .: :                              


P.tricornutum   ---------------------------------------------
A.aegypti       PAA----------------AAVDASAYHAYEQQQQHHHAHSQVED
D.rerio         PPPMMGPPPPM---GMPPMP-P---D---MQGSTEAHDGTEEVEE
H.sapiens       TQ--------------------------------STMQTYEEVGD
M.musculus      TQ--------------------------------STMQTYEEVGD
S.mansoni       -TSIAGGGTLVGDATVQQHAFVDAAASHLYARALQQGTGS-----

cons                                                         


P.tricornutum   ---------------------------------------------
A.aegypti       EELTLVDHKYTLDVEKLNR-EVMERDRNLYDALESSKWMPVEQ-L
D.rerio         DP--SEDPNPQVDVEELNR-QYMERSEELYDSLMECHWLPMDT-I
H.sapiens       DA--LEDPMPQLDVTEANK-EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-V
M.musculus      DA--LEDPAPQLDVTEANK-EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-V
S.mansoni       -Q--EYAPEPHVLSSACDRPRHVDDLDEVFNFLESSRWHVTDPSL

cons                                                         


P.tricornutum   ----KT--YA
A.aegypti       E-------IF
D.rerio         TSDISMMNGS
H.sapiens       SSEIPA--MM
M.musculus      SSEIPA--MM
S.mansoni       GLFIKI--RP

cons