T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame
CPU TIME:0 sec.
SCORE=85
*
BAD AVG GOOD
*
T.trahens : 92
A.aegypti : 82
D.rerio : 84
H.sapiens : 88
M.musculus : 88
S.mansoni : 78
cons : 85
T.trahens -------------------------------TVVSAKIILDAETHGSA
A.aegypti MSSIQCQLWMGSLESYMTENFILAAFRKMGEDPQTVKLMRNKYTGDPA
D.rerio MFNRMTSLWMGDLDPYMDENFIKQAFSTMGETAFGVKIITHRVTGGSA
H.sapiens M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
M.musculus M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
S.mansoni MQNFSHTIWMGDLEPYMDEMFIKRAFETSGENIVSVKVIRNKATGQTL
cons .*:: . * .
T.trahens GYGFVEFETREGAQAAMPILQGRRVR----ALRIRINWAVQGSRRVAD
A.aegypti GYCFVSFKTDEAAIDAMHKLNGKPIPGTNPLVRFRLNSATNNQNKALL
D.rerio GYCFVEMADEASVDRCVQRLNGKLVPGSNPPRKFKLNYATYGKR--PE
H.sapiens GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQ--PD
M.musculus GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQ--PD
S.mansoni GYGFIEFANSTSARDAMLKLNGKLIPGA-PTRRFKLNHASYGKD--ST
cons ** *:.: . .: ::*: : ::::* * ..
T.trahens EDGLHSLFVGDLCKSVDDDMLHDAFA-HFSSLTSARVMWDVRTGTSRE
A.aegypti ADREFSVWVGDLSSDVDDYSLYRVFSAKYTSIKTAKVILD-SSGFSKG
D.rerio PGPEFSVFVGDLTSEVDDYQLHQFFLKKFPSCKGAKVVTD-PYGNSRG
H.sapiens NSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLD-QTGVSKG
M.musculus NSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLD-PTGVSKG
S.mansoni SSNECSLFVGELTEDVDDLALFNAF-KKYPTCRSAKVVM--TNGKSRG
cons . *::**:* .*** *. * :.: .:*: * *:
T.trahens FGFVSFRDASDAERALKTMGG-TMLGRRPIRVNRANK-----------
A.aegypti YGFVKFGLEDEQKSALYEMNGFIGLGCKPLKICNAVPKPKNELGPAGP
D.rerio YGFVKFSDENEQKKALEEFQNASGLGGKPIRISIAVNKGNKAS-TY--
H.sapiens YGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRVK-PV--
M.musculus YGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGCKPVRLSVAIPKASRVK-PV--
S.mansoni YGFVRFLTESDMDKALIEMQNYCGLGYKPIRVSLAIPKRYNADGSLVV
cons :*** * : . ** . ** :*::: *
T.trahens ------------------------------------------------
A.aegypti TSST--PS---------------AASLLGYGTATDYS-QYYDPSTYWQ
D.rerio -------H---------------NQN-NT--YNTNYQQQYYQQ-PY-N
H.sapiens -----------------------EYS-QM--YSYSYN-QYYQQ--Y-Q
M.musculus -----------------------EYS-QM--YSYSYN-QYYQQ--Y-Q
S.mansoni TTTASETSSVVPSGMPDPFTAAVAAAVTG--NSAAQA-EYYQA--Y-Q
cons
T.trahens ------------------------------------------------
A.aegypti NYSAWQGYYDATGTADYSAYQM--P-----------------------
D.rerio SYYPQWGYDQYSG-YNYGYNPY--AA-----PPPMMGPPPPMGMPPMP
H.sapiens NYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQY--GY-----TQ---------------
M.musculus NYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQY--GY-----TQ---------------
S.mansoni QYYQQYYASQYAA-QFYSSESSTNGDSANSGITSIAGGGTLVGDATVQ
cons
T.trahens ------------------------------------------------
A.aegypti AAAAVDASAYHAYEQQQQHHHAHSQVEDEELTLVDHKYTLDVEKLNR-
D.rerio --P-----D---MQGSTEAHDGTEEVEEDP--SEDPNPQVDVEELNR-
H.sapiens -----------------STMQTYEEVGDDA--LEDPMPQLDVTEANK-
M.musculus -----------------STMQTYEEVGDDA--LEDPAPQLDVTEANK-
S.mansoni QHAFVDAAASHLYARALQQGTGS------Q--EYAPEPHVLSSACDRP
cons
T.trahens ----------------------------------K
A.aegypti EVMERDRNLYDALESSKWMPVEQ-LE-------IF
D.rerio QYMERSEELYDSLMECHWLPMDT-ITSDISMMNGS
H.sapiens EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
M.musculus EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
S.mansoni RHVDDLDEVFNFLESSRWHVTDPSLGLFIKI--RP
cons