T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=85
*
 BAD AVG GOOD
*
T.trahens    :  92
A.aegypti    :  82
D.rerio      :  84
H.sapiens    :  88
M.musculus   :  88
S.mansoni    :  78
cons         :  85

T.trahens    -------------------------------TVVSAKIILDAETHGSA
A.aegypti    MSSIQCQLWMGSLESYMTENFILAAFRKMGEDPQTVKLMRNKYTGDPA
D.rerio      MFNRMTSLWMGDLDPYMDENFIKQAFSTMGETAFGVKIITHRVTGGSA
H.sapiens    M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
M.musculus   M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
S.mansoni    MQNFSHTIWMGDLEPYMDEMFIKRAFETSGENIVSVKVIRNKATGQTL

cons                                            .*:: .  *  . 


T.trahens    GYGFVEFETREGAQAAMPILQGRRVR----ALRIRINWAVQGSRRVAD
A.aegypti    GYCFVSFKTDEAAIDAMHKLNGKPIPGTNPLVRFRLNSATNNQNKALL
D.rerio      GYCFVEMADEASVDRCVQRLNGKLVPGSNPPRKFKLNYATYGKR--PE
H.sapiens    GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQ--PD
M.musculus   GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQ--PD
S.mansoni    GYGFIEFANSTSARDAMLKLNGKLIPGA-PTRRFKLNHASYGKD--ST

cons         ** *:.:     .  .:  ::*: :       ::::* *  ..     


T.trahens    EDGLHSLFVGDLCKSVDDDMLHDAFA-HFSSLTSARVMWDVRTGTSRE
A.aegypti    ADREFSVWVGDLSSDVDDYSLYRVFSAKYTSIKTAKVILD-SSGFSKG
D.rerio      PGPEFSVFVGDLTSEVDDYQLHQFFLKKFPSCKGAKVVTD-PYGNSRG
H.sapiens    NSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLD-QTGVSKG
M.musculus   NSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLD-PTGVSKG
S.mansoni    SSNECSLFVGELTEDVDDLALFNAF-KKYPTCRSAKVVM--TNGKSRG

cons          .   *::**:*  .***  *.  *   :.:   .:*:     * *: 


T.trahens    FGFVSFRDASDAERALKTMGG-TMLGRRPIRVNRANK-----------
A.aegypti    YGFVKFGLEDEQKSALYEMNGFIGLGCKPLKICNAVPKPKNELGPAGP
D.rerio      YGFVKFSDENEQKKALEEFQNASGLGGKPIRISIAVNKGNKAS-TY--
H.sapiens    YGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRVK-PV--
M.musculus   YGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGCKPVRLSVAIPKASRVK-PV--
S.mansoni    YGFVRFLTESDMDKALIEMQNYCGLGYKPIRVSLAIPKRYNADGSLVV

cons         :*** *    : . **    .   ** :*:::  *             


T.trahens    ------------------------------------------------
A.aegypti    TSST--PS---------------AASLLGYGTATDYS-QYYDPSTYWQ
D.rerio      -------H---------------NQN-NT--YNTNYQQQYYQQ-PY-N
H.sapiens    -----------------------EYS-QM--YSYSYN-QYYQQ--Y-Q
M.musculus   -----------------------EYS-QM--YSYSYN-QYYQQ--Y-Q
S.mansoni    TTTASETSSVVPSGMPDPFTAAVAAAVTG--NSAAQA-EYYQA--Y-Q

cons                                                         


T.trahens    ------------------------------------------------
A.aegypti    NYSAWQGYYDATGTADYSAYQM--P-----------------------
D.rerio      SYYPQWGYDQYSG-YNYGYNPY--AA-----PPPMMGPPPPMGMPPMP
H.sapiens    NYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQY--GY-----TQ---------------
M.musculus   NYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQY--GY-----TQ---------------
S.mansoni    QYYQQYYASQYAA-QFYSSESSTNGDSANSGITSIAGGGTLVGDATVQ

cons                                                         


T.trahens    ------------------------------------------------
A.aegypti    AAAAVDASAYHAYEQQQQHHHAHSQVEDEELTLVDHKYTLDVEKLNR-
D.rerio      --P-----D---MQGSTEAHDGTEEVEEDP--SEDPNPQVDVEELNR-
H.sapiens    -----------------STMQTYEEVGDDA--LEDPMPQLDVTEANK-
M.musculus   -----------------STMQTYEEVGDDA--LEDPAPQLDVTEANK-
S.mansoni    QHAFVDAAASHLYARALQQGTGS------Q--EYAPEPHVLSSACDRP

cons                                                         


T.trahens    ----------------------------------K
A.aegypti    EVMERDRNLYDALESSKWMPVEQ-LE-------IF
D.rerio      QYMERSEELYDSLMECHWLPMDT-ITSDISMMNGS
H.sapiens    EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
M.musculus   EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
S.mansoni    RHVDDLDEVFNFLESSRWHVTDPSLGLFIKI--RP

cons