T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame
CPU TIME:0 sec.
SCORE=79
*
BAD AVG GOOD
*
E.siliculosus : 74
A.aegypti : 77
D.rerio : 80
H.sapiens : 84
M.musculus : 84
S.mansoni : 74
cons : 79
E.siliculosus ----AKTLWLGDVQPDWTEEYVESLFSSIVGQELEVKLIRDRHRG
A.aegypti MSSIQCQLWMGSLESYMTENFILAAFRKMGEDPQTVKLMRNKYTG
D.rerio MFNRMTSLWMGDLDPYMDENFIKQAFSTMGETAFGVKIITHRVTG
H.sapiens M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTG
M.musculus M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTG
S.mansoni MQNFSHTIWMGDLEPYMDEMFIKRAFETSGENIVSVKVIRNKATG
cons :*:*.::. * :: * . **:: .: *
E.siliculosus IVAGYGFIDFRNHETAQLVLDSLNGKPIEGTS--LRYRLNWGAGG
A.aegypti DPAGYCFVSFKTDEAAIDAMHKLNGKPIPGTNPLVRFRLNSATNN
D.rerio GSAGYCFVEMADEASVDRCVQRLNGKLVPGSNPPRKFKLNYATYG
H.sapiens IPAGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYG
M.musculus IPAGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYG
S.mansoni QTLGYGFIEFANSTSARDAMLKLNGKLIPGA-PTRRFKLNHASYG
cons ** *:.: :. : :*** : *: :::** .: .
E.siliculosus KR--IEQAPEYSVFVGDLSPEVTDAELKATFLGKYTSVLGAKVVT
A.aegypti QNKALLADREFSVWVGDLSSDVDDYSLYRVFSAKYTSIKTAKVIL
D.rerio KR--PEPGPEFSVFVGDLTSEVDDYQLHQFFLKKFPSCKGAKVVT
H.sapiens KQ--PDNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVL
M.musculus KQ--PDNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVL
S.mansoni KD--STSSNECSLFVGELTEDVDDLALFNAF-KKYPTCRSAKVVM
cons : * *::**:*: :* * * * :.: .**:
E.siliculosus NPMTGSSKSFGFIRFGDEQERDEALTAMNGAECCG-RPIRVAPAT
A.aegypti DS-SGFSKGYGFVKFGLEDEQKSALYEMNGFIGLGCKPLKICNAV
D.rerio DP-YGNSRGYGFVKFSDENEQKKALEEFQNASGLGGKPIRISIAV
H.sapiens DQ-TGVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAI
M.musculus DP-TGVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGCKPVRLSVAI
S.mansoni T--NGKSRGYGFVRFLTESDMDKALIEMQNYCGLGYKPIRVSLAI
cons * *:.:**::* * : . ** :. * :*:::. *
E.siliculosus KRTSVQV-PWY-------------------------YS--TLHTH
A.aegypti PKPKNELGPAGPTSST--PS--------------AASLLGYGTAT
D.rerio NKGNKAS-TYH------------------------NQN--NTYNT
H.sapiens PKASRVK-PVE-------------------------YS--QMYSY
M.musculus PKASRVK-PVE-------------------------YS--QMYSY
S.mansoni PKRYNADGSLVVTTTASETSSVVPSGMPDPFTAAVAAAV-TGNSA
cons : .
E.siliculosus IH-ADSPQQ--H-RSG-----------------------------
A.aegypti DYS-QYYDPSTYWQNYSAWQGYYDATGTADYSAYQ--MPA-A---
D.rerio NYQQQYYQQ-PY-NSYYPQWGYDQYSG-YNYGYNP--YAA-----
H.sapiens SY-NQYYQQ--Y-QNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQ--YGY-----
M.musculus SY-NQYYQQ--Y-QNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQ--YGY-----
S.mansoni AQ-AEYYQA--Y-QQYYQQYYASQYAA-QFYSSESSTNGDSANSG
cons : : : ..
E.siliculosus --------------------------------------VSDEVDA
A.aegypti -------------------AAVDASAYHAYEQQQQHHHAHSQVED
D.rerio PPPMMGPPPPMGMPPM--PP-----D---MQGSTEAHDGTEEVEE
H.sapiens TQ--------------------------------STMQTYEEVGD
M.musculus TQ--------------------------------STMQTYEEVGD
S.mansoni ITSIAGGGTLVGDATVQQHAFVDAAASHLYARALQQGTGSQE---
cons .:
E.siliculosus NA--LLHITAVLFCEEESESYIYMKVTKRALQDPVM------LDS
A.aegypti EELTLVDHKYTLDVEKLNR--EVMERD-RNLYDALESSKWMPVEQ
D.rerio DP--SEDPNPQVDVEELNR--QYMERS-EELYDSLMECHWLPMDT
H.sapiens DA--LEDPMPQLDVTEANK--EFMEQS-EELYDALMDCHWQPLDT
M.musculus DA--LEDPAPQLDVTEANK--EFMEQS-EELYDALMDCHWQPLDT
S.mansoni -----YAPEPHVLSSACDRP-RHVDDL-DEVFNFLESSRWHVTDP
cons : .. :. : : : :
E.siliculosus -LSTRAFFFASS
A.aegypti -LE-------IF
D.rerio -ITSDISMMNGS
H.sapiens -VSSEIP--AMM
M.musculus -VSSEIP--AMM
S.mansoni SLGLFIK--IRP
cons :