T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=82
*
 BAD AVG GOOD
*
P.pallidum   :  79
A.aegypti    :  79
D.rerio      :  82
H.sapiens    :  87
M.musculus   :  87
S.mansoni    :  76
cons         :  82

P.pallidum   -----TSLYVGDLAPDVNEIMLSELFSKVGRSAVASIHVCRDSITFRS
A.aegypti    MSSIQCQLWMGSLESYMTENFILAAFRKMGED-PQTVKLMRNKYTGDP
D.rerio      MFNRMTSLWMGDLDPYMDENFIKQAFSTMGET-AFGVKIITHRVTGGS
H.sapiens    M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGET-VMSVKIIRNRLTGIP
M.musculus   M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGET-VMSVKIIRNRLTGIP
S.mansoni    MQNFSHTIWMGDLEPYMDEMFIKRAFETSGEN-IVSVKVIRNKATGQT

cons                :::*.* . : * ::   * . *.     :::  .  *  .


P.pallidum   LGYAYVNFFNSIDAERALDTLNYSQIMGRPCRIMWSLRDPTKRK--S-
A.aegypti    AGYCFVSFKTDEAAIDAMHKLNGKPIPGTNPLVRFRLNSATNNQNKAL
D.rerio      AGYCFVEMADEASVDRCVQRLNGKLVPGSNPPRKFKLNYATYGKRP--
H.sapiens    AGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQP--
M.musculus   AGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQP--
S.mansoni    LGYGFIEFANSTSARDAMLKLNGKLIPGA-PTRRFKLNHASYGKDS--

cons          ** ::.:     .  .:  :* . : *      : *. .:  :    


P.pallidum   ---NVGNIFVKNLDKQVDNAMLFDTFS-KFGNILSCKIEY-EKGVSKG
A.aegypti    LADREFSVWVGDLSSDVDDYSLYRVFSAKYTSIKTAKVILDSSGFSKG
D.rerio      EPGPEFSVFVGDLTSEVDDYQLHQFFLKKFPSCKGAKVVTDPYGNSRG
H.sapiens    DNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQTGVSKG
M.musculus   DNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDPTGVSKG
S.mansoni    TSSNECSLFVGELTEDVDDLALFNAFK-KYPTCRSAKVVM-TNGKSRG

cons               .::* :*  :**:  *.  *   : .    *:     * *:*


P.pallidum   YGYVHFETQESSDRAIQGVNGTM-LCGKPITVEQFVSKVERFKEK---
A.aegypti    YGFVKFGLEDEQKSALYEMNGFIGLGCKPLKICNAVPKPKNELGPAGP
D.rerio      YGFVKFSDENEQKKALEEFQNASGLGGKPIRISIAVNKGNKASTY---
H.sapiens    YGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRVKPV---
M.musculus   YGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGCKPVRLSVAIPKASRVKPV---
S.mansoni    YGFVRFLTESDMDKALIEMQNYCGLGYKPIRVSLAIPKRYNADGSLVV

cons         **:*:*  : . . *:   :.   *  **: :   : *  .       


P.pallidum   -----------------------NEH-KL--FIKNID-ELATG--Y-H
A.aegypti    TSST--P-----S----------AASLLGYGTATDYS-QYYDPSTYWQ
D.rerio      ------------H----------NQN-NT--YNTNYQQQYYQQ-PY-N
H.sapiens    -----------------------EYS-QM--YSYSYN-QYYQQ--Y-Q
M.musculus   -----------------------EYS-QM--YSYSYN-QYYQQ--Y-Q
S.mansoni    TTTASETSSVVPSGMPDPFTAAVAAAVTG--NSAAQA-EYYQA--Y-Q

cons                                               :      * :


P.pallidum   HYYCQWRRDNQQQQQHYHTS----------------------------
A.aegypti    NYSAWQGYYDATGTADYSAYQM--PA-A--------------------
D.rerio      SYYPQWGYDQYSG-YNYGYNPY--AA-----PPPMMGPPPPM---GMP
H.sapiens    NYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQY--GY-----TQ---------------
M.musculus   NYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQY--GY-----TQ---------------
S.mansoni    QYYQQYYASQYAA-QFYSSESSTNGDSANSGITSIAGGGTLVGDATVQ

cons          *       :      *                               


P.pallidum   ------------------------------------------------
A.aegypti    --AAVDASAYHAYEQ-QQQHHHAHSQVEDEELTLVDHKYTLDVEKLNR
D.rerio      PMP--------PDMQGSTEAHDGTEEVEEDP--SEDPNPQVDVEELNR
H.sapiens    ---------------S---TMQTYEEVGDDA--LEDPMPQLDVTEANK
M.musculus   ---------------S---TMQTYEEVGDDA--LEDPAPQLDVTEANK
S.mansoni    QHAFVDAAASHLYAR-ALQQGTGS------Q--EYAPEPHVLSSACDR

cons                                                         


P.pallidum   ----------------------------------KY
A.aegypti    -EVMERDRNLYDALESSKWMPVEQ-LE-------IF
D.rerio      -QYMERSEELYDSLMECHWLPMDT-ITSDISMMNGS
H.sapiens    -EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
M.musculus   -EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
S.mansoni    PRHVDDLDEVFNFLESSRWHVTDPSLGLFIKI--RP

cons