T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=78
*
 BAD AVG GOOD
*
C.muris      :  70
A.aegypti    :  77
D.rerio      :  80
H.sapiens    :  84
M.musculus   :  84
S.mansoni    :  72
cons         :  78

C.muris      V---SASLYVGDLDPDVTETMLYEIFNSVA-VVSSVRICRDALTRRSL
A.aegypti    MSSIQCQLWMGSLESYMTENFILAAFRKMGEDPQTVKLMRNKYTGDPA
D.rerio      MFNRMTSLWMGDLDPYMDENFIKQAFSTMGETAFGVKIITHRVTGGSA
H.sapiens    M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
M.musculus   M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
S.mansoni    MQNFSHTIWMGDLEPYMDEMFIKRAFETSGENIVSVKVIRNKATGQTL

cons         :      :::*.*:. : * ::   * . .     *::  .  *  . 


C.muris      GYAYVNYNSVADAERALDTLNFTCIRSR-PCRI---MWCLRD--PASR
A.aegypti    GYCFVSFKTDEAAIDAMHKLNGKPIPGTNPLVRFRLNSATNNQNKALL
D.rerio      GYCFVEMADEASVDRCVQRLNGKLVPGSNPPRKFKLNYATYGKR--PE
H.sapiens    GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQ--PD
M.musculus   GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQ--PD
S.mansoni    GYGFIEFANSTSARDAMLKLNGKLIPGA-PTRRFKLNHASYGKD--ST

cons         ** ::.      .  .:  :* . : .  *        .  .      


C.muris      RNNEGNVFVKNLDKSIDNKTLFDTF-SLFGNIMSCKIATDSEGNSLGY
A.aegypti    ADREFSVWVGDLSSDVDDYSLYRVFSAKYTSIKTAKVILDSSGFSKGY
D.rerio      PGPEFSVFVGDLTSEVDDYQLHQFFLKKFPSCKGAKVVTDPYGNSRGY
H.sapiens    NSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQTGVSKGY
M.musculus   NSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDPTGVSKGY
S.mansoni    SSNECSLFVGELTEDVDDLALFNAF-KKYPTCRSAKVVM-TNGKSRGY

cons          . * .::* :*  .:*:  *.  *   : .    *:     * * **


C.muris      GFIHFEHPESAKEAIARLNVLICWFGSRCYRDYVIRNFAIRYNIFCYD
A.aegypti    GFVKFGLEDEQKSALYEMNGFI-GLGCKPLKICNAVPKPKNELG----
D.rerio      GFVKFSDENEQKKALEEFQNAS-GLGGKPIRISIAVNKGNKAS-----
H.sapiens    GFVKFTDELEQKRALTECQGAV-GLGSKPVRLSVAIPKASRVK-----
M.musculus   GFVKFTDELEQKRALTECQGAV-GLGCKPVRLSVAIPKASRVK-----
S.mansoni    GFVRFLTESDMDKALIEMQNYC-GLGYKPIRVSLAIPKRYNADG----

cons         **::*    . . *: . :     :* :  :         .       


C.muris      IWYLRFWIRLIFISRGYKSYNDAPISKRPCCCSYCSRKYNFKNRTRTL
A.aegypti    --------------------PAGPTSST----------------PS--
D.rerio      --------------------TY-----------------------H--
H.sapiens    --------------------PV--------------------------
M.musculus   --------------------PV--------------------------
S.mansoni    --------------------SLVVTTTA-----------S---ETSS-

cons                                                         


C.muris      NIVCKSNFNETTIGKLFIFYKIANFY--CLYLHSYS-TFYRKLYKYCR
A.aegypti    ---------------------A-ASLLGYGTATDYS-QYYDPS-TYWQ
D.rerio      -----------------------NQN--NTYNTNYQQQYYQQ--PY-N
H.sapiens    -----------------------EYS--QMYSYSYN-QYYQQ---Y-Q
M.musculus   -----------------------EYS--QMYSYSYN-QYYQQ---Y-Q
S.mansoni    -VVPSGMPDPFTAA-------V-AAAV-TGNSAAQA-EYYQA---Y-Q

cons                                               :*     * .


C.muris      NF-INWRFKK----YNYTGKS-IKRYR-----D---------------
A.aegypti    NYSAWQGYYDATGTADYSAY-Q-M--P-----AA--------------
D.rerio      SYYPQWGYDQYSG-YNYGYN-P-YAAP-----PPMMGPPPPM---GMP
H.sapiens    NYYAQWGYDQNTGSYSYSYP-Q-YGYT-----Q---------------
M.musculus   NYYAQWGYDQNTGSYSYSYP-Q-YGYT-----Q---------------
S.mansoni    QYYQQYYASQYAA-QFYSSESSTNGDSANSGITSIAGGGTLVGDATVQ

cons         .:       .      *                               


C.muris      -----------------NTPTTYFKMGD--------------------
A.aegypti    --AAVDASAYHAYEQQQQHHHAHSQVEDEELTLVDHKYTLDVEKLNR-
D.rerio      PMP-P---D---MQGSTEAHDGTEEVEEDP--SEDPNPQVDVEELNR-
H.sapiens    -----------------STMQTYEEVGDDA--LEDPMPQLDVTEANK-
M.musculus   -----------------STMQTYEEVGDDA--LEDPAPQLDVTEANK-
S.mansoni    QHAFVDAAASHLYARALQQGTGS------Q--EYAPEPHVLSSACDRP

cons                          .                              


C.muris      ------------------------------S--IL
A.aegypti    EVMERDRNLYDALESSKWMPVEQ-LE-------IF
D.rerio      QYMERSEELYDSLMECHWLPMDT-ITSDISMMNGS
H.sapiens    EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
M.musculus   EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
S.mansoni    RHVDDLDEVFNFLESSRWHVTDPSLGLFIKI--RP

cons